| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2908679 | 53 (1.020) | 4 (0.090) | 3/90 | NT | 7.1% | intergenic (‑49/‑330) | treR/mgtA | DNA‑binding transcriptional repressor/magnesium transporter |
| ? | minE | = 2908693 | 58 (1.270) | intergenic (‑63/‑316) | treR/mgtA | DNA‑binding transcriptional repressor/magnesium transporter | |||||
TGATGGTCAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGTATTATATCGCCA > minE/2908609‑2908746 | tGATGGTCAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCC > 1:3078949‑M1/1‑71 (MQ=255) aTGGTCAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCg < 1:57174/70‑1 (MQ=255) gTCAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCa > 1:3268400/1‑71 (MQ=255) cAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCAtt > 1:3935943/1‑71 (MQ=255) cAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCAtt > 1:365854/1‑71 (MQ=255) cAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCAtt > 1:3570690/1‑71 (MQ=255) ccGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAg > 1:309835/1‑71 (MQ=255) gATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCattgctgaatg > 1:1294349‑M1/1‑59 (MQ=255) gATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCattgctgaatg > 1:2001487‑M1/1‑59 (MQ=255) gATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAga > 1:1612327/1‑69 (MQ=255) ttttGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAAt > 1:502035/1‑71 (MQ=255) ttttGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAAt > 1:1911439/1‑71 (MQ=255) cATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGc < 1:2484747/63‑1 (MQ=255) cATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgggta > 1:948581‑M2/1‑66 (MQ=255) cATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgggta > 1:2817515‑M2/1‑66 (MQ=255) cATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgggta > 1:2262357‑M2/1‑66 (MQ=255) aTCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgggtaa > 1:3211330‑M2/1‑65 (MQ=255) tCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTaaa < 1:269497/71‑1 (MQ=255) ccTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCa < 1:2328557/61‑1 (MQ=255) cTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCaa > 1:3744172/1‑61 (MQ=255) tgttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTc > 1:2622619/1‑71 (MQ=255) tgttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTc > 1:1988313/1‑71 (MQ=255) ttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTTAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgggta > 1:2719212‑M2/1‑59 (MQ=255) ttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCt < 1:3004141/70‑1 (MQ=255) ttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTg > 1:2084910/1‑71 (MQ=255) ttgtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTg > 1:749042/1‑71 (MQ=255) gtCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGt > 1:3854598/1‑71 (MQ=255) gtCATGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTgg < 1:204749/70‑1 (MQ=255) ccTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGtt > 1:1246843/1‑70 (MQ=255) cTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCAt < 1:487258/46‑1 (MQ=255) cTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGttt < 1:3208881/70‑1 (MQ=255) cTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGttt < 1:3009262/70‑1 (MQ=255) cTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTa < 1:145231/71‑1 (MQ=255) cTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTa > 1:1870133/1‑71 (MQ=255) tAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgg < 1:1005284‑M2/53‑3 (MQ=255) tAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCg > 1:2989919/1‑71 (MQ=255) aaCGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCg > 1:2729016/1‑70 (MQ=255) aCGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGt < 1:2721133/70‑1 (MQ=255) cGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCAt < 1:901294/40‑1 (MQ=255) cGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGt < 1:1108133/69‑1 (MQ=255) gtgtTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTg < 1:2529982/70‑1 (MQ=255) tgttgtTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCg < 1:644499/66‑1 (MQ=255) gttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTgg < 1:2863224/69‑1 (MQ=255) gttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTgg < 1:412652/69‑1 (MQ=255) gttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTgg < 1:1074388/69‑1 (MQ=255) ttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCa > 1:860604/1‑39 (MQ=255) ttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTaaa > 1:1205212/1‑51 (MQ=255) ttgttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGtt > 1:1996148/1‑70 (MQ=255) gttTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCattgctgaatgc < 1:2556361‑M1/40‑13 (MQ=255) tttAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAg < 1:1256158/70‑1 (MQ=255) ttAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCattgctgaatgcac > 1:3865185‑M1/1‑26 (MQ=255) tAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgg > 1:3899066‑M2/1‑39 (MQ=255) tAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATgg > 1:1516266‑M2/1‑39 (MQ=255) tAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGtt < 1:2980340/70‑1 (MQ=255) tAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTg > 1:857455/1‑71 (MQ=255) aaTTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCa < 1:2761851/36‑1 (MQ=255) ttattTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGt > 1:1463286/1‑69 (MQ=255) tttGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTcagc < 1:2222613/70‑1 (MQ=255) ttGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTcagcag > 1:2589041/1‑71 (MQ=255) aGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGta < 1:2747649/71‑1 (MQ=255) ccTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGtatt < 1:1349010/71‑1 (MQ=255) ccTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGtatt < 1:1783246/71‑1 (MQ=255) cTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGttt < 1:68797/42‑1 (MQ=255) tAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGtatta > 1:247046/1‑70 (MQ=255) aaCGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTcagcag < 1:2553114/63‑1 (MQ=255) aCGTTAGCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGtattat < 1:2595727/69‑1 (MQ=255) aCGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGTATtata < 1:552441/70‑1 (MQ=255) aCGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGTATTatat > 1:2427780/1‑71 (MQ=255) ttACCCattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataattaaacaacacgttacaggacaacaggat > 1:3211330‑M1/1‑6 (MQ=255) tACCCattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataattaaacaacacgttacaggacaacaggatg > 1:948581‑M1/1‑5 (MQ=255) tACCCattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataattaaacaacacgttacaggacaacaggatg > 1:2817515‑M1/1‑5 (MQ=255) tACCCattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataattaaacaacacgttacaggacaacaggatg > 1:2262357‑M1/1‑5 (MQ=255) tACCCattgctgaatgcacgggtaacgttaggctaaaataattaaacaacacgttacaggacaa > 1:2719212‑M1/1‑5 (MQ=255) tACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTg > 1:3811567/1‑42 (MQ=255) aCCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTTGtt < 1:2787017/49‑1 (MQ=255) aCCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTcagcag > 1:1949837/1‑57 (MQ=255) cccGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGTATTATATCGCCa < 1:3864974/70‑1 (MQ=255) ccattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataattaaacaacacgtta < 1:1005284‑M1/53‑52 (MQ=255) ccattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataatta > 1:1516266‑M1/1‑2 (MQ=255) ccattgctgaatgcacgggtaacgttaggctcaaataatta > 1:3899066‑M1/1‑2 (MQ=255) | TGATGGTCAGCCGATTTTGCATCCTGTTGTCCTGTAACGTGTTGTTTAATTATTTGAGCCTAACGTTACCCGTGCATTCAGCAATGGGTAAAGTCTGGTTTATCGTTGGTTTAGTTGTCAGCAGGTATTATATCGCCA > minE/2908609‑2908746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |