| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2918569 = | 51 (0.980) | 3 (0.070) | 3/90 | NT | 7.1% | coding (1749/1815 nt) | yjgL | hypothetical protein |
| ? | minE | 2918613 = | 34 (0.740) | coding (1793/1815 nt) | yjgL | hypothetical protein | |||||
CAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCA > minE/2918501‑2918632 | cAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATc > 1:3693722/1‑70 (MQ=255) aaaCTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCa > 1:1787169/1‑71 (MQ=255) taaagatgccgggaaatacaaaccatcccggcatcacattattttatgcagtgataggtctattctTCCAc < 1:623779‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCAc < 1:1801854/71‑1 (MQ=255) aCTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCAcc > 1:3020247/1‑71 (MQ=255) cTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCa > 1:2750742/1‑68 (MQ=255) tATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAAt < 1:1321852/64‑1 (MQ=255) tCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGa > 1:3295116/1‑70 (MQ=255) gCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGaa < 1:694321/67‑1 (MQ=255) gCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGaa < 1:2894940/67‑1 (MQ=255) cAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAttt < 1:122030/71‑1 (MQ=255) cAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAttt < 1:2509487/71‑1 (MQ=255) cAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAtt < 1:884651/70‑1 (MQ=255) aaTCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAAt < 1:305521/56‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTTATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTAc < 1:2775132/71‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTAc < 1:2882725/71‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACACCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTAc < 1:3324410/71‑1 (MQ=255) tCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACg < 1:61474/71‑1 (MQ=255) cGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACg > 1:3325296/1‑70 (MQ=255) aaaccatcccggcatcacattattttatgcagtgataggtctattctTCCAcc > 1:2597464‑M1/48‑53 (MQ=255) ttAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTa > 1:3791731/1‑62 (MQ=255) ttAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCa < 1:2981332/71‑1 (MQ=255) aaccatcccggcatcacattattttatgcagtgataggtctattcttc > 1:2437219‑M1/47‑48 (MQ=255) aaTGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGtat > 1:739156/1‑65 (MQ=255) gTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCAc > 1:3722655/1‑46 (MQ=255) tATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGaa < 1:739875/71‑1 (MQ=255) aTTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATa > 1:3245377/1‑67 (MQ=255) aTTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGaa < 1:2120840/70‑1 (MQ=255) ttACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAac > 1:2154382/1‑70 (MQ=255) tACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCa > 1:2133089/1‑41 (MQ=255) tACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCa > 1:522324/1‑41 (MQ=255) gcatcacattattttatgcagtgataggtctattctTCCa < 1:2246121‑M1/4‑1 (MQ=255) ccATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACtt > 1:1691254/1‑71 (MQ=255) cATATATTAATGAACAGCGTTTAATTAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACttt > 1:1098386/1‑71 (MQ=255) cATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGa < 1:2518214/43‑1 (MQ=255) cATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACttt > 1:3017558/1‑71 (MQ=255) cATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACtt < 1:1843963/70‑1 (MQ=255) atatatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACttt < 1:1647689/70‑1 (MQ=255) atatatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTg > 1:46483/1‑71 (MQ=255) atatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAtt > 1:3069861/1‑45 (MQ=255) atatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAtt > 1:1446334/1‑45 (MQ=255) atatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTggg > 1:1518344/1‑71 (MQ=255) atatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTggg > 1:3578304/1‑71 (MQ=255) tatTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACg < 1:2646338/48‑1 (MQ=255) cattattttatgcagtgataggtctattctTCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTggg > 1:3752509‑M1/31‑70 (MQ=255) atTAATGAACAGAGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTg > 1:3687988/1‑71 (MQ=255) ttattttatgcagtgataggtctattctTCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTgg > 1:2504491‑M1/29‑71 (MQ=255) ttattttatgcagtgataggtctattctTCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTg < 1:2705682‑M1/42‑1 (MQ=255) ttAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTa < 1:3190173/44‑1 (MQ=255) ttAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTa < 1:2197383/44‑1 (MQ=255) ttAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTgg < 1:3409595/71‑1 (MQ=255) ttAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTg > 1:1596005/1‑70 (MQ=255) tAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACTGGaaaa < 1:1302/39‑1 (MQ=255) aaTGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAAtt < 1:1357568/40‑1 (MQ=255) aaTGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTggg > 1:2043161/1‑66 (MQ=255) aTGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaag < 1:2095392/71‑1 (MQ=255) tGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaag > 1:3848842/1‑70 (MQ=255) aaCAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaagaa > 1:3242459/1‑70 (MQ=255) aaCAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaagaa < 1:682838/70‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAAt < 1:419484/71‑1 (MQ=255) cAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGaa < 1:931131/51‑1 (MQ=255) aGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTa > 1:1352374/1‑35 (MQ=255) gCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTgg > 1:1832297/1‑57 (MQ=255) taaataaaCTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAAt > 1:317969/1‑62 (MQ=255) taaataaaCTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTAt < 1:871133/70‑1 (MQ=255) aCTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaag < 1:203435/52‑1 (MQ=255) aCTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGgaag < 1:1271269/52‑1 (MQ=255) cTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTAt < 1:2713006/62‑1 (MQ=255) aaTCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCa > 1:714644/1‑66 (MQ=255) | CAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCA > minE/2918501‑2918632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |