| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 61 (1.180) | 110 (2.300) | 55/94 | NT | 70.5% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 36 (0.750) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGC > minE/2705949‑2706087 | gcACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:2427912/70‑1 (MQ=255)gCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:1329350‑M2/1‑70 (MQ=255) cacaCGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAat > 1:3016565‑M2/1‑69 (MQ=255) acGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAatt < 1:3636057‑M2/69‑4 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:1219970‑M2/71‑7 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagc < 1:2795286‑M2/71‑8 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATtctc > 1:3403143/1‑70 (MQ=255) aaaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct < 1:1624285‑M2/70‑9 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:175481‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:1153963‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct < 1:21047‑M2/69‑9 (MQ=255) aaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct < 1:3349126‑M2/68‑9 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga < 1:3865166‑M2/71‑13 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2999065‑M2/1‑59 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:3103465‑M2/1‑59 (MQ=255) aGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGgag > 1:1200679/1‑70 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:3055315‑M2/71‑16 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcac > 1:2340616‑M2/1‑51 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGAt > 1:1816771/1‑71 (MQ=255) gAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaag > 1:402093‑M2/1‑50 (MQ=255) gacTCCTGG‑TTTGTACAAAGCCAGCAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactg < 1:933469‑M2/70‑23 (MQ=255) aCTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata > 1:720773/1‑48 (MQ=255) aCTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGa > 1:2142253/1‑70 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg > 1:3583885‑M2/1‑45 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatt < 1:3877927‑M2/70‑27 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaag < 1:1516875‑M2/55‑12 (MQ=255) tgGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAatt < 1:1841137‑M2/46‑4 (MQ=255) tttGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagat < 1:2129299‑M2/70‑32 (MQ=255) ttGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatg < 1:1677470‑M2/70‑33 (MQ=255) ttGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatg < 1:1564250‑M2/70‑33 (MQ=255) ttGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatg < 1:3258155‑M2/70‑33 (MQ=255) gTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGa < 1:592326/70‑1 (MQ=255) tACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGAtt < 1:2935003/71‑1 (MQ=255) tACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGAt < 1:3714540/70‑1 (MQ=255) tACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGAt < 1:2709939/70‑1 (MQ=255) cAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac < 1:3193166‑M2/70‑38 (MQ=255) cAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac < 1:1798000‑M2/70‑38 (MQ=255) cAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactgga < 1:2632099‑M2/57‑25 (MQ=255) cAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGc > 1:255311/1‑71 (MQ=255) aaa‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacga > 1:3606787‑M2/1‑32 (MQ=255) aaa‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:2262217‑M2/1‑32 (MQ=255) aa‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgat > 1:968067‑M2/1‑31 (MQ=255) a‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgatt < 1:489881‑M2/71‑42 (MQ=255) a‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga < 1:2880702‑M2/42‑13 (MQ=255) ccAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:529778‑M2/44‑16 (MQ=255) ccAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGccccc < 1:3025410/71‑1 (MQ=255) ccAGGAGTCGTTTCACCCGCG‑AAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCt > 1:3777514/1‑71 (MQ=255) aGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaa > 1:890154‑M2/1‑27 (MQ=255) aGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt > 1:1955050‑M2/1‑24 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttga < 1:3940763‑M2/71‑50 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgat < 1:1012228‑M2/60‑41 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgat < 1:2018716‑M2/60‑41 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTg < 1:2320394/71‑1 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttga > 1:3142503‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaa > 1:3021502‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgca > 1:2873203‑M2/1‑19 (MQ=255) ttCACACGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:815740‑M2/71‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:2827362‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:3724268‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:3273942‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:1711008‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacga < 1:2728378‑M2/56‑40 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa < 1:2924290‑M2/51‑35 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCg > 1:2329891/1‑71 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCg > 1:1456367/1‑71 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatt > 1:3876955‑M2/1‑16 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg < 1:1366932‑M2/70‑55 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:92810‑M2/1‑16 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:1607195‑M2/1‑16 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:3624593‑M2/1‑16 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGt < 1:901301/44‑1 (MQ=255) aCCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatga > 1:260849‑M2/1‑15 (MQ=255) cccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaac > 1:2110336‑M2/1‑14 (MQ=255) cccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaac < 1:1406345‑M2/71‑58 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagccactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaact < 1:1346389‑M2/71‑59 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaact > 1:1869003‑M2/1‑13 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaact < 1:1233615‑M2/71‑59 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaa < 1:3501638‑M2/49‑37 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTa < 1:2892059/42‑1 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:16660‑M2/71‑60 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc > 1:334157‑M2/1‑12 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactct > 1:3388269‑M2/1‑11 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:2410723‑M2/70‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:715308‑M2/70‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactgga < 1:1006296‑M2/35‑25 (MQ=255) gcgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAt > 1:1380335/1‑71 (MQ=255) gcgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAt > 1:2185914/1‑71 (MQ=255) gAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctac > 1:2971507‑M2/1‑9 (MQ=255) gAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactcta < 1:3681317‑M2/70‑62 (MQ=255) gAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactcta < 1:2100927‑M2/70‑62 (MQ=255) gAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAttt < 1:1395618/71‑1 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacacttcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctaca > 1:1494983‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaaTAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTg < 1:3758714/71‑1 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaa < 1:3362585‑M2/41‑36 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:156781‑M2/1‑3 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg > 1:2231603‑M2/1‑3 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctata > 1:2650718‑M2/1‑2 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctata > 1:2650279‑M2/1‑2 (MQ=255) taatTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTc > 1:2880396/1‑55 (MQ=255) aattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctata > 1:1925857‑M2/1‑1 (MQ=255) | GCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAA‑CCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGC > minE/2705949‑2706087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |