| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 436833 | 60 (1.160) | 149 (2.880) | 63/102 | NT | 74.3% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | 1803907 = | 43 (0.830) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TTATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTTC > minE/1803837‑1803977 | ttATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATc > 1:838920/1‑71 (MQ=255)ttATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATc > 1:340328/1‑71 (MQ=255) atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:858446‑M2/70‑71 (MQ=255) atataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCgg > 1:3620647/1‑71 (MQ=255) cgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc > 1:3441847‑M2/68‑71 (MQ=255) gaacacatcctgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctacCgg < 1:1506822‑M2/3‑1 (MQ=255) taACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCt < 1:161750/70‑1 (MQ=255) taACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTg < 1:2829840/71‑1 (MQ=255) aacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCt > 1:3680657‑M2/66‑70 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTg > 1:2397890‑M2/65‑70 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:2617322‑M2/7‑1 (MQ=255) cacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa > 1:92854‑M2/64‑70 (MQ=255) catcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:2085600‑M2/10‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt > 1:819823‑M2/61‑70 (MQ=255) acaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt > 1:185059/1‑70 (MQ=255) catgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:799459‑M2/59‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa < 1:2681800‑M2/13‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:1541353‑M2/15‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:3189500‑M2/15‑1 (MQ=255) cagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGa < 1:2785214‑M2/16‑1 (MQ=255) aaTCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg > 1:519391/1‑71 (MQ=255) agtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAgg < 1:3137761‑M2/18‑1 (MQ=255) aTCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg < 1:3619473/70‑1 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:900157/1‑70 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCt < 1:2874551‑M2/5‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCt < 1:2187143‑M2/5‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:3771500‑M2/21‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:786349‑M2/22‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaAGGCTGAAATTAAt > 1:2200592‑M2/50‑63 (MQ=255) atgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:622660‑M2/22‑1 (MQ=255) ttcccgtcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:4453‑M2/43‑55 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:3202507‑M2/43‑71 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:3015979‑M2/43‑71 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3949585‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACACaaa > 1:2138042‑M2/43‑71 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:3832195/1‑69 (MQ=255) cggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:2114381‑M2/14‑1 (MQ=255) cggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:2497629‑M2/39‑52 (MQ=255) cggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:2318183‑M2/33‑1 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa < 1:3306633‑M2/29‑1 (MQ=255) gcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:1190102‑M2/37‑69 (MQ=255) cggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:2548287‑M2/36‑49 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt > 1:1158681‑M2/35‑71 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt < 1:1468517‑M2/37‑1 (MQ=255) cggaattgattgagaaggtttgggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt > 1:3289636‑M2/35‑71 (MQ=255) gaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAg > 1:3159823‑M2/34‑50 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTc < 1:2006884/70‑1 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:167690‑M2/32‑71 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCt < 1:751241‑M2/5‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCt < 1:3218544‑M2/5‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:3253312‑M2/31‑71 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:1924524‑M2/29‑47 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:69310‑M2/29‑70 (MQ=255) gaatgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:1748727‑M2/29‑69 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTAAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:2989781/1‑70 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:1046315/70‑1 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:1976110‑M2/28‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:1105168‑M2/21‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:3327744‑M2/27‑55 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:1377843‑M2/28‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:610865‑M2/28‑1 (MQ=255) ttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACg > 1:1832260/1‑71 (MQ=255) tgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt > 1:1591729‑M2/26‑68 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:1651296‑M2/25‑57 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACg < 1:3356355‑M2/46‑1 (MQ=255) agaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGc < 1:3389246‑M2/47‑1 (MQ=255) gaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:689736‑M2/23‑43 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGATATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa < 1:198572‑M2/50‑1 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGCTCGTTTACGCCCa < 1:1012938‑M2/50‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGa < 1:2434495‑M2/54‑1 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:1566842‑M2/17‑46 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:3668181‑M2/17‑46 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:3932788‑M2/17‑71 (MQ=255) gTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa > 1:3043097/1‑70 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:2282789‑M2/28‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaa < 1:35123‑M2/58‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaa < 1:1569548‑M2/58‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa < 1:589877/71‑1 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:404616‑M2/40‑1 (MQ=255) gaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAAt < 1:2962701‑M2/60‑1 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2721437/1‑39 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:562525‑M2/11‑62 (MQ=255) ttACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt < 1:1729273/46‑1 (MQ=255) actatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGc > 1:2222008‑M2/10‑71 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGc > 1:2241134/1‑69 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAAt > 1:2380684‑M2/7‑66 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTa > 1:3413199‑M2/7‑70 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaa < 1:130542‑M2/65‑1 (MQ=255) tataTCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaa > 1:1293307/1‑70 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:3458138/1‑71 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt < 1:2421907‑M2/63‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt < 1:1122999‑M2/63‑1 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:493988/70‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa < 1:547026‑M2/67‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaa < 1:2605499‑M2/66‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt < 1:389434‑M2/70‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:1478070‑M2/69‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:28376‑M2/69‑1 (MQ=255) cGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:1781568/69‑1 (MQ=255) cGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTTc < 1:1363488/71‑1 (MQ=255) | TTATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTTC > minE/1803837‑1803977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |