| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1476009 | 68 (1.310) | 6 (0.130) | 3/92 | NT | 8.5% | coding (1074/1131 nt) | nrdB | ribonucleoside diphosphate reductase 1, beta subunit, ferritin‑like |
| ? | minE | = 1476015 | 68 (1.450) | coding (1080/1131 nt) | nrdB | ribonucleoside diphosphate reductase 1, beta subunit, ferritin‑like | |||||
ACTTGGCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGTTACCCTG > minE/1475947‑1476083 | acTTGGCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGca > 1:98132‑M2/1‑69 (MQ=255) cTTGGCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGcag > 1:1759398‑M2/1‑68 (MQ=255) ggCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGcagat > 1:3212313‑M2/1‑65 (MQ=255) ggCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGcaga > 1:2681196‑M2/1‑65 (MQ=255) gCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGAtt > 1:381064/1‑70 (MQ=255) ggTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACt > 1:1082719/1‑71 (MQ=255) gtgtCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGAtt < 1:2340905/66‑1 (MQ=255) tgtCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCg < 1:2401115/71‑1 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGAtt > 1:2914164/1‑63 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGAtt > 1:3292394/1‑63 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGa < 1:2124396/65‑1 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCgg > 1:778291/1‑70 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGa < 1:1642798/71‑1 (MQ=255) tCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGa < 1:3604302/71‑1 (MQ=255) tGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAg > 1:2059052/1‑71 (MQ=255) gATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGt > 1:114767/1‑71 (MQ=255) aTAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGt < 1:2316642/70‑1 (MQ=255) aTAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGt < 1:2644682/70‑1 (MQ=255) aTAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTg < 1:2467475/71‑1 (MQ=255) aCGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCggg > 1:854565/1‑50 (MQ=255) aCGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCTGGCAGATTGACTCGGAAGTGGac < 1:3148877/71‑1 (MQ=255) aCGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGac < 1:3386559/71‑1 (MQ=255) aCGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGa < 1:3168047/70‑1 (MQ=255) aCGTGCAGGTTGCTACGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCggg > 1:355089/1‑50 (MQ=255) gTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGcagat > 1:2381500‑M2/1‑48 (MQ=255) cAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcg < 1:792089/70‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcgac > 1:849354/1‑70 (MQ=255) gTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTg < 1:971702/60‑1 (MQ=255) gTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcgacga > 1:429563/1‑71 (MQ=255) ttGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGAt < 1:1306663/71‑1 (MQ=255) tGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGa > 1:1047635/1‑48 (MQ=255) cTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCg > 1:2361369/1‑50 (MQ=255) cTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGAttt < 1:3678876/70‑1 (MQ=255) cGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAg > 1:2969361/1‑70 (MQ=255) cGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAg > 1:989686/1‑70 (MQ=255) cGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAg > 1:2296561/1‑70 (MQ=255) cAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGAt < 1:381626/63‑1 (MQ=255) cAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTaa > 1:3629431/1‑71 (MQ=255) cAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTaa > 1:3402417/1‑71 (MQ=255) cAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTaa > 1:429112/1‑71 (MQ=255) aGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTc < 1:2393369/43‑1 (MQ=255) ggaagtggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACt < 1:3264101/71‑1 (MQ=255) gaagtggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACtt > 1:592138/1‑71 (MQ=255) aagtggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGATGt < 1:2371962/46‑1 (MQ=255) aagtggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTc < 1:3185437/71‑1 (MQ=255) agtggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAAc > 1:1658416/1‑67 (MQ=255) ggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGt > 1:1783861/1‑42 (MQ=255) ggaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGt > 1:2288714/1‑42 (MQ=255) gaagtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGct < 1:1042696/71‑1 (MQ=255) agtCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGt < 1:2209733/58‑1 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGt < 1:5764/56‑1 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTc > 1:3350149/1‑62 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGctct < 1:3135564/69‑1 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGctct < 1:2616978/69‑1 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGctct < 1:679947/69‑1 (MQ=255) tCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGa < 1:527683/71‑1 (MQ=255) cAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTgg < 1:1495529/38‑1 (MQ=255) cAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGa < 1:2135706/53‑1 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGa > 1:1205269/1‑52 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAg < 1:2408220/63‑1 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATg > 1:314003/1‑71 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATg < 1:3076680/71‑1 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATg > 1:649603/1‑71 (MQ=255) aGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATg > 1:2455844/1‑71 (MQ=255) gTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTg < 1:2118511/35‑1 (MQ=255) gTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcgac > 1:433194/1‑44 (MQ=255) gTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTcc < 1:3357362/60‑1 (MQ=255) tCTTATCTGGTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacgttatcagacac < 1:2536417‑M2/69‑55 (MQ=255) tCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGcc > 1:2107668/1‑71 (MQ=255) cTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGccc > 1:271697/1‑71 (MQ=255) cTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGcc < 1:2645174/70‑1 (MQ=255) cTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACAACGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGccc > 1:829118/1‑71 (MQ=255) ttATCTGGTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacg > 1:1559504‑M2/1‑13 (MQ=255) ttATCTGGTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacg > 1:2918929‑M2/1‑13 (MQ=255) ttATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcgacga < 1:2030144/42‑1 (MQ=255) tATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCcgc > 1:2762948/1‑71 (MQ=255) aTCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGAtt > 1:2876881/1‑42 (MQ=255) aTCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCcgc < 1:1981033/70‑1 (MQ=255) aTCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCcg < 1:1888061/69‑1 (MQ=255) tCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGt > 1:3627554/1‑71 (MQ=255) tCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGt > 1:669670/1‑71 (MQ=255) cTGGTCGGGCAGATTGACTGGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGc < 1:2901967/64‑1 (MQ=255) ggTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacgtta > 1:1771032‑M2/1‑7 (MQ=255) ggTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacgtta > 1:2909729‑M2/1‑7 (MQ=255) ggTCGGGcagataagaactgacttccacttcctgcggagcaacctgcacgtta > 1:2914399‑M2/1‑7 (MQ=255) ggTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACcgacg > 1:2285154/1‑35 (MQ=255) ggTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACt > 1:1446074/1‑47 (MQ=255) gTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGTTAcc < 1:426939/71‑1 (MQ=255) tCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGTTAccc > 1:2651934/1‑71 (MQ=255) gggCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGTTACCCTg > 1:421716/1‑71 (MQ=255) | ACTTGGCTGGTGTCTGATAACGTGCAGGTTGCTCCGCAGGAAGTGGAAGTCAGTTCTTATCTGGTCGGGCAGATTGACTCGGAAGTGGACACCGACGATTTGAGTAACTTCCAGCTCTGATGGCCCGCGTTACCCTG > minE/1475947‑1476083 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |