| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 1869856 = | 43 (0.830) | 5 (0.110) | 4/90 | NT | 11.0% | intergenic (‑101/‑218) | ygcW/yqcE | predicted deoxygluconate dehydrogenase/predicted transporter |
| ? | minE | 1869880 = | 43 (0.940) | intergenic (‑125/‑194) | ygcW/yqcE | predicted deoxygluconate dehydrogenase/predicted transporter | |||||
GGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCA > minE/1869812‑1869950 | gggAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtgt > 1:614062/1‑71 (MQ=255)gggAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtg > 1:2895942/1‑70 (MQ=255) ggAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtgtg < 1:961094/71‑1 (MQ=255) gAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTTGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGa < 1:3470788/71‑1 (MQ=255) gAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGa < 1:615143/71‑1 (MQ=255) aGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATc > 1:384629/1‑71 (MQ=255) aGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATc > 1:86432/1‑71 (MQ=255) atttgacaatacgaatatcacactgtgattacgatcacaTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGa > 1:3929838‑M1/40‑68 (MQ=255) ttACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGa < 1:1405056/67‑1 (MQ=255) aCCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTa < 1:2689826/70‑1 (MQ=255) ccTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAAt < 1:281280/71‑1 (MQ=255) ccTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAAt > 1:1707866/1‑71 (MQ=255) cTTTCTCATTATCTCTGGTAACAGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAAt > 1:1839448/1‑70 (MQ=255) ttCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATcac > 1:2831786/1‑71 (MQ=255) ttCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATca > 1:3470717/1‑70 (MQ=255) tctcATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGAt > 1:2771893/1‑61 (MQ=255) gaatatcacactgtgattacgatcacaTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAt < 1:1242013‑M1/25‑1 (MQ=255) aTTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAgtgt > 1:2802778/1‑71 (MQ=255) tATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGa > 1:1895918/1‑71 (MQ=255) tctcTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTaa < 1:2766128/58‑1 (MQ=255) ctctGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGtgtg < 1:2568932/67‑1 (MQ=255) gTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTa < 1:1659820/71‑1 (MQ=255) cTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGatat < 1:3913370/62‑1 (MQ=255) ggAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTc > 1:3270931/1‑70 (MQ=255) gagaTAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTa < 1:905622/64‑1 (MQ=255) gaTAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCaaa > 1:2196482/1‑70 (MQ=255) gaTAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCaaa > 1:317784/1‑70 (MQ=255) gaTAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCaaa > 1:1433005/1‑70 (MQ=255) tAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaataa < 1:2846748/71‑1 (MQ=255) tcacattagcagttatgcccttatgctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaat > 1:3929838‑M2/30‑68 (MQ=255) aaTTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaataat > 1:3504898/1‑71 (MQ=255) aaTTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaataat > 1:89759/1‑71 (MQ=255) aTTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtt < 1:2904620/71‑1 (MQ=255) aTTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtt < 1:3126952/71‑1 (MQ=255) tttAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAgtgt < 1:298073/45‑1 (MQ=255) tttAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtttt > 1:360435/1‑70 (MQ=255) tttAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtttt < 1:2217990/70‑1 (MQ=255) attagcagttatgcccttatgctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTc < 1:1242013‑M2/27‑1 (MQ=255) tagcagttatgcccttatgctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGt > 1:1368452‑M2/24‑52 (MQ=255) tagcagttatgcccttatgctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGt > 1:550232‑M2/24‑52 (MQ=255) gcagttatgcccttatgctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTaaaaa < 1:3369305‑M2/50‑1 (MQ=255) CATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAg > 1:1823715‑M1/1‑71 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGt < 1:285521/47‑1 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGt < 1:115226/47‑1 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAg > 1:3748040/1‑69 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAg > 1:87691/1‑69 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGc > 1:1064570/1‑70 (MQ=255) tAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGc > 1:3705669/1‑70 (MQ=255) aaGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACATTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCa < 1:3835814/70‑1 (MQ=255) aaGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTc > 1:1528023/1‑44 (MQ=255) aaGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTc > 1:1002199/1‑44 (MQ=255) aaGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGtttt < 1:2627687/49‑1 (MQ=255) aaGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAg > 1:2435914/1‑68 (MQ=255) aGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGtgtg > 1:2982447/1‑37 (MQ=255) aGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTa > 1:3763086/1‑46 (MQ=255) gggCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAg > 1:2916893/1‑69 (MQ=255) gggCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAg > 1:2912124/1‑69 (MQ=255) aaCTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTaa < 1:3050568/56‑1 (MQ=255) aCTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTc > 1:2929483/1‑43 (MQ=255) aCTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTaaa > 1:3476767/1‑56 (MQ=255) aCTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGAt < 1:3194643/71‑1 (MQ=255) aCTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGAt < 1:1324278/71‑1 (MQ=255) cTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGAt > 1:337938/1‑70 (MQ=255) ctaaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTAct < 1:1314396‑M2/67‑1 (MQ=255) aaTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTActct > 1:2119368‑M2/3‑71 (MQ=255) aTGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTActct < 1:1734713‑M2/69‑1 (MQ=255) tgtgATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtttt < 1:378128/45‑1 (MQ=255) tgtgATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTca < 1:963435/71‑1 (MQ=255) | GGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCA > minE/1869812‑1869950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |