| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 42716 | 42 (0.710) | 4 (0.080) | 3/88 | NT | 10.0% | coding (859/1287 nt) | fixC | predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| ? | minE | = 42759 | 36 (0.710) | coding (902/1287 nt) | fixC | predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain | |||||
CACCGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAA > minE/42651‑42783 | cACCGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACAtg < 1:3265946/71‑1 (MQ=255) ccGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACTtgct > 1:3420566/1‑71 (MQ=255) ccGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACAtgct > 1:1784549/1‑71 (MQ=255) cGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACAtgctg > 1:2925975/1‑71 (MQ=255) cTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGcc > 1:2792871/1‑71 (MQ=255) tCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAg < 1:3547365/71‑1 (MQ=255) gcgggcggCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAAc < 1:443042/57‑1 (MQ=255) gcgggcggCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgt < 1:1027193/70‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCgg < 1:2852037/64‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCgg < 1:3572887/64‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCgg < 1:2530016/64‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCgg < 1:1773175/64‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggt < 1:2926400/71‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggt < 1:3478536/71‑1 (MQ=255) cAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttgg < 1:3508313/65‑1 (MQ=255) cAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTtggttggt < 1:3097375/70‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggttg > 1:3022028/1‑66 (MQ=255) aGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggttg > 1:2869797/1‑66 (MQ=255) aGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTtggttggt > 1:756323/1‑68 (MQ=255) aGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGAc > 1:2506386/1‑71 (MQ=255) aGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGAc < 1:2396363/71‑1 (MQ=255) cTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACgg < 1:1522733/71‑1 (MQ=255) ggtggAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAAc > 1:767505/1‑43 (MQ=255) ggtggAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAAc > 1:3345835/1‑43 (MQ=255) ggtgcAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAAc > 1:3341466/1‑43 (MQ=255) gtggAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg < 1:2331671/70‑1 (MQ=255) tggAATATACCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACgg < 1:2383968/67‑1 (MQ=255) gAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAccggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactccg > 1:663816‑M1/1‑37 (MQ=255) gAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAccggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactc > 1:1387386‑M1/1‑37 (MQ=255) gAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg > 1:3612084/1‑67 (MQ=255) gAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg > 1:3065205/1‑67 (MQ=255) tatTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAccggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactccgg > 1:403406‑M1/1‑34 (MQ=255) ttCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTattgattg > 1:1991213/1‑71 (MQ=255) tCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACAtgctgc > 1:1069333/1‑40 (MQ=255) ccGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggt > 1:921424/1‑49 (MQ=255) ccGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggt > 1:1023764/1‑49 (MQ=255) ccGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGcc > 1:1527186/1‑71 (MQ=255) ccGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGcc > 1:1711020/1‑71 (MQ=255) ccGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGcc > 1:3180953/1‑71 (MQ=255) cGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg < 1:1695766/59‑1 (MQ=255) cGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg < 1:1542463/59‑1 (MQ=255) cGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCg < 1:2295232/59‑1 (MQ=255) cGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGcc < 1:230542/70‑1 (MQ=255) aCGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAccggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactccggcagcatgttg < 1:1892087‑M1/69‑46 (MQ=255) gTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAgttggt > 1:1954120/1‑38 (MQ=255) ccGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCgg < 1:3223562/71‑1 (MQ=255) ccGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCgg < 1:684305/71‑1 (MQ=255) aGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAAtgt > 1:1269222/1‑71 (MQ=255) cAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCAGCCGGAATgtgt < 1:110657/71‑1 (MQ=255) aGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTa > 1:1456082/1‑71 (MQ=255) ggCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTAt < 1:2790742/71‑1 (MQ=255) cATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGa < 1:2625083/71‑1 (MQ=255) tCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCTGTGATgccg < 1:607305/54‑1 (MQ=255) tCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATg < 1:614809/68‑1 (MQ=255) cAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCg < 1:3366857/44‑1 (MQ=255) cAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCg < 1:1617336/44‑1 (MQ=255) cAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGtgatgcctgcttccggcactacgt < 1:1892087‑M2/69‑25 (MQ=255) accggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactccggcagcatgt < 1:369783‑M1/44‑44 (MQ=255) accggcaatcaatacgccgtcaccaaccaactccggcagcatgt < 1:53370‑M1/44‑44 (MQ=255) aaCATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAAtg < 1:2040313/60‑1 (MQ=255) | CACCGCTGATCGCGGGCGGCAAGCTGGTGGAATATTCCGCTCACGTAGTGCCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAA > minE/42651‑42783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |