| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 42716 | 42 (0.710) | 4 (0.080) | 3/88 | NT | 10.0% | coding (859/1287 nt) | fixC | predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| ? | minE | = 42759 | 36 (0.710) | coding (902/1287 nt) | fixC | predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain | |||||
CCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTGCCGCCGG > minE/42701‑42828 | ccGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCgg < 1:3223562/71‑1 (MQ=255)ccGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCgg < 1:684305/71‑1 (MQ=255) aGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAAtgt > 1:1269222/1‑71 (MQ=255) cAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCAGCCGGAATgtgt < 1:110657/71‑1 (MQ=255) aGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTa > 1:1456082/1‑71 (MQ=255) ggCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTAt < 1:2790742/71‑1 (MQ=255) cATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGa < 1:2625083/71‑1 (MQ=255) tCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCTGTGATgccg < 1:607305/54‑1 (MQ=255) tCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATg < 1:614809/68‑1 (MQ=255) cAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGtgatgcctgcttccggcactacgt < 1:1892087‑M2/69‑25 (MQ=255) aaCATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAAtg < 1:2040313/60‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGt < 1:53370‑M2/44‑2 (MQ=255) aCATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGt < 1:369783‑M2/44‑2 (MQ=255) aTGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCgg > 1:1568571/1‑71 (MQ=255) tgctgcCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGt > 1:1428495/1‑71 (MQ=255) tgctgcCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGt > 1:2801075/1‑71 (MQ=255) ctgcCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGttt < 1:3398894/71‑1 (MQ=255) ctgcCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGttt < 1:772034/71‑1 (MQ=255) ctgcCGGAGTTGGTTGGGGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGttt < 1:57507/71‑1 (MQ=255) ccGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGtgatgcctgcttccggcactacgtgagcggaata > 1:403406‑M2/1‑35 (MQ=255) ccGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGtttt < 1:1725426/69‑1 (MQ=255) cGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGtgatgcctgcttccggcactacgtgagcggaatattc > 1:663816‑M2/1‑34 (MQ=255) gAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGtgatgcctgcttccggcactacgtgagcggaatattc > 1:1387386‑M2/1‑32 (MQ=255) gAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCAt < 1:1710810/71‑1 (MQ=255) ttggttggTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTc < 1:3023807/57‑1 (MQ=255) ggttggtGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTcgc < 1:2311368/70‑1 (MQ=255) ttggtGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTcgcg < 1:845344/69‑1 (MQ=255) ggtGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCgg < 1:2533779/68‑1 (MQ=255) ggtGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTAt > 1:819178/1‑71 (MQ=255) tGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAAtg < 1:1802079/37‑1 (MQ=255) aCGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGa > 1:1103622/1‑70 (MQ=255) cGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATc > 1:1432560/1‑71 (MQ=255) ggCGTATTGATTGCCGGTGATGCCTCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCt < 1:2864629/71‑1 (MQ=255) ggCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCt < 1:2717110/71‑1 (MQ=255) gCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTcgcg < 1:3034381/60‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTa > 1:3128462/1‑50 (MQ=255) gTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTAt < 1:2130627/35‑1 (MQ=255) gTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGc < 1:3409984/71‑1 (MQ=255) tATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGc < 1:109133/70‑1 (MQ=255) ttgattgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATgg < 1:1945886/61‑1 (MQ=255) ttgattgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATc < 1:2906693/64‑1 (MQ=255) ttgattgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATc < 1:1366632/64‑1 (MQ=255) ttgattgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGa < 1:2844486/70‑1 (MQ=255) tgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTgccg > 1:1792000/1‑71 (MQ=255) tgCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTgccg > 1:945536/1‑71 (MQ=255) ggTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTGCCGCCgg < 1:2854527/71‑1 (MQ=255) ggTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTGCCGCCgg < 1:2000107/71‑1 (MQ=255) ggTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTGCCGCCgg < 1:1263856/71‑1 (MQ=255) | CCGGAAGCAGGCATCAACATGCTGCCGGAGTTGGTTGGTGACGGCGTATTGATTGCCGGTGATGCCGCCGGAATGTGTATGAACCTCGGTTTTACCATTCGCGGTATGGATCTGGCGATTGCCGCCGG > minE/42701‑42828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |