| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 732619 | 55 (0.930) | 7 (0.130) | 4/96 | NT | 13.4% | coding (65/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
| ? | minE | = 732639 | 39 (0.700) | coding (85/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex | |||||
GCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGA > minE/732549‑732689 | gCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGG > 1:928674‑M1/1‑71 (MQ=255)gCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGG > 1:153527‑M1/1‑71 (MQ=255) ggTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGa > 1:3176072/1‑71 (MQ=255) gTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGAt > 1:1362574/1‑71 (MQ=255) tGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgt < 1:1028547/71‑1 (MQ=255) tGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgt < 1:2458632/71‑1 (MQ=255) tGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgt > 1:1826798/1‑71 (MQ=255) tGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgt > 1:3497390/1‑71 (MQ=255) ttCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgttg < 1:174173/71‑1 (MQ=255) ttCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGgttg < 1:3184442/71‑1 (MQ=255) ttaattaaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGttt > 1:2765419/1‑71 (MQ=255) attaaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt < 1:1570039/69‑1 (MQ=255) attaaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGttt < 1:1845981/68‑1 (MQ=255) taaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacca > 1:3000054/1‑71 (MQ=255) aaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTaccac > 1:334363/1‑71 (MQ=255) aCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTaccac < 1:3060068/70‑1 (MQ=255) ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1086895‑M2/71‑2 (MQ=255) ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1833495‑M2/71‑2 (MQ=255) ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACAACCGc < 1:1472132‑M2/71‑2 (MQ=255) ggTAATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1041538‑M2/71‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGt < 1:1808826/49‑1 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca < 1:544051‑M1/71‑24 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGcca > 1:2685006‑M2/1‑68 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:590521‑M2/69‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1795060‑M2/69‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATCGTTGTTTTACCACCg > 1:1832732/1‑68 (MQ=255) aTAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGa > 1:3071008/1‑49 (MQ=255) aTAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGa > 1:3631733/1‑49 (MQ=255) aaGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcaccaaa > 1:1179577‑M1/1‑44 (MQ=255) aaGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGt > 1:82088/1‑71 (MQ=255) aGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt < 1:3558028/71‑1 (MQ=255) aGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt < 1:2448331/71‑1 (MQ=255) cAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCagag > 1:2044534/1‑67 (MQ=255) aGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATc < 1:1591545/71‑1 (MQ=255) ggAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATc > 1:2707837/1‑70 (MQ=255) gAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGa < 1:1950263/71‑1 (MQ=255) tCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCag < 1:1893430/59‑1 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt > 1:2409367/1‑46 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt > 1:2188832/1‑46 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt > 1:805974/1‑46 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt > 1:1292700/1‑46 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacca > 1:1926743/1‑50 (MQ=255) gCTGGCAGTAAGCGATCGGGAAACGCAGTTTGGTGATGGTTGtttt > 1:1111597/1‑46 (MQ=255) cTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacca < 1:2174780/49‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaa < 1:3642679/71‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaa < 1:144011/71‑1 (MQ=255) tGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca > 1:645086‑M1/1‑31 (MQ=255) tGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca > 1:1162750‑M1/1‑31 (MQ=255) ggCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAg > 1:3271301/1‑71 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaaa < 1:2799371/69‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2114413/71‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2462335/71‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2375660/71‑1 (MQ=255) cAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacc > 1:3229720/1‑44 (MQ=255) cAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacc > 1:1077787/1‑44 (MQ=255) cAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTacc > 1:2258974/1‑44 (MQ=255) aGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca > 1:742942‑M1/1‑27 (MQ=255) aGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca > 1:659158‑M1/1‑27 (MQ=255) aGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGcggtggtaaaacaaccatcacca > 1:2475616‑M1/1‑27 (MQ=255) aGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAg > 1:2577733/1‑68 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:2562475/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:688319/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:655490/71‑1 (MQ=255) aGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGttt > 1:9713/1‑71 (MQ=255) aGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGttt > 1:260153/1‑71 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:3294814/1‑49 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:3553895/1‑49 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:243729/1‑49 (MQ=255) aTCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTa < 1:1892359/71‑1 (MQ=255) tCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTAAGTTTGTTAt > 1:3294267/1‑71 (MQ=255) cGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc > 1:2077082/1‑71 (MQ=255) cGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc > 1:2530188/1‑71 (MQ=255) gggCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc < 1:2245739/70‑1 (MQ=255) gCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCata < 1:2417836/71‑1 (MQ=255) gTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATc > 1:2538687/1‑70 (MQ=255) gTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATc > 1:3439071/1‑70 (MQ=255) tttGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgctt > 1:1179577‑M2/1‑25 (MQ=255) tttGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGgc > 1:670246/1‑62 (MQ=255) tGGcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatga > 1:2685006‑M1/1‑3 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatga < 1:544051‑M2/71‑49 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgcca > 1:1162750‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgcca > 1:645086‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:659158‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:742942‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:2475616‑M2/1‑23 (MQ=255) gcggttgtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatgacc < 1:1472132‑M1/71‑71 (MQ=255) gcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttattacc < 1:1041538‑M1/71‑71 (MQ=255) gcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatgacc < 1:1833495‑M1/71‑71 (MQ=255) gcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatgacc < 1:1086895‑M1/71‑71 (MQ=255) gcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatga < 1:1795060‑M1/69‑69 (MQ=255) gcggtggtaaaacaaccatcaccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatga < 1:590521‑M1/69‑69 (MQ=255) | GCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGA > minE/732549‑732689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |