| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 732619 | 55 (0.930) | 7 (0.130) | 4/96 | NT | 13.4% | coding (65/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
| ? | minE | = 732639 | 39 (0.700) | coding (85/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex | |||||
GGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCG > minE/732570‑732709 | ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1086895‑M2/71‑2 (MQ=255)ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1833495‑M2/71‑2 (MQ=255)ggTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACAACCGc < 1:1472132‑M2/71‑2 (MQ=255)ggTAATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1041538‑M2/71‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGcca > 1:2685006‑M2/1‑68 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:590521‑M2/69‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGc < 1:1795060‑M2/69‑2 (MQ=255) tCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATCGTTGTTTTACCACCg > 1:1832732/1‑68 (MQ=255) aaGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGt > 1:82088/1‑71 (MQ=255) aGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt < 1:2448331/71‑1 (MQ=255) aGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt < 1:3558028/71‑1 (MQ=255) cAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCagag > 1:2044534/1‑67 (MQ=255) aGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATc < 1:1591545/71‑1 (MQ=255) ggAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATc > 1:2707837/1‑70 (MQ=255) gAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGa < 1:1950263/71‑1 (MQ=255) tCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCag < 1:1893430/59‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaa < 1:3642679/71‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaa < 1:144011/71‑1 (MQ=255) ggCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAg > 1:3271301/1‑71 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTaaa < 1:2799371/69‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2114413/71‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2375660/71‑1 (MQ=255) gCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGt < 1:2462335/71‑1 (MQ=255) aGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAg > 1:2577733/1‑68 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:655490/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:688319/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGt < 1:2562475/71‑1 (MQ=255) aGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGttt > 1:9713/1‑71 (MQ=255) aGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGttt > 1:260153/1‑71 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:243729/1‑49 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:3553895/1‑49 (MQ=255) cGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGtt > 1:3294814/1‑49 (MQ=255) aTCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTa < 1:1892359/71‑1 (MQ=255) tCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTAAGTTTGTTAt > 1:3294267/1‑71 (MQ=255) cGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc > 1:2530188/1‑71 (MQ=255) cGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc > 1:2077082/1‑71 (MQ=255) gggCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATc < 1:2245739/70‑1 (MQ=255) gCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCata < 1:2417836/71‑1 (MQ=255) gTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATc > 1:2538687/1‑70 (MQ=255) gTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATc > 1:3439071/1‑70 (MQ=255) tttGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgctt > 1:1179577‑M2/1‑25 (MQ=255) tttGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGgc > 1:670246/1‑62 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgccagcgattcctgcttatga < 1:544051‑M2/71‑49 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgcca > 1:645086‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttactgcca > 1:1162750‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:659158‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:742942‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGTGATGGTTGTTTTACCACCGccaaactgcgttgcccgatcgcttact > 1:2475616‑M2/1‑23 (MQ=255) aTGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTa < 1:1710086/50‑1 (MQ=255) aTGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTa > 1:3710166/1‑71 (MQ=255) aTGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTa > 1:635111/1‑71 (MQ=255) tGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTAc < 1:2479995/71‑1 (MQ=255) gttgttTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAg < 1:2217075/71‑1 (MQ=255) ttgttTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAg > 1:3358291/1‑70 (MQ=255) ttgttTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAg > 1:3315162/1‑70 (MQ=255) ttgttTAACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAg > 1:923/1‑70 (MQ=255) gttTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGa < 1:481472/70‑1 (MQ=255) ttttACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATg > 1:1949198/1‑71 (MQ=255) ttttACAACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATg > 1:1953601/1‑71 (MQ=255) ttACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAg > 1:2908572/1‑56 (MQ=255) accaccGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCtt < 1:3296305/70‑1 (MQ=255) accaccGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCtt > 1:2366108/1‑70 (MQ=255) accGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACa > 1:3673977/1‑59 (MQ=255) accGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACa > 1:3678349/1‑59 (MQ=255) accGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCa < 1:2609314/71‑1 (MQ=255) cGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGc < 1:2104832/71‑1 (MQ=255) gCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGa > 1:3358664/1‑59 (MQ=255) gCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGa > 1:2539420/1‑59 (MQ=255) gCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCg < 1:1777988/71‑1 (MQ=255) | GGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCG > minE/732570‑732709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |