| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 869212 | 51 (0.860) | 10 (0.190) | 4/92 | NT | 18.2% | coding (927/1050 nt) | sohB | predicted inner membrane peptidase |
| ? | minE | = 869257 | 44 (0.830) | coding (972/1050 nt) | sohB | predicted inner membrane peptidase | |||||
GAGAAAGGCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCGGCAGAGAGC > minE/869144‑869281 | gagaAAGGCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAg < 1:313485/70‑1 (MQ=255) aaGGCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGt > 1:700586/1‑70 (MQ=255) aGGCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTc > 1:1346126/1‑70 (MQ=255) gCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAAt > 1:1807935/1‑71 (MQ=255) tGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgag > 1:353092‑M1/1‑59 (MQ=255) gTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACg > 1:250537/1‑71 (MQ=255) gTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACg > 1:2422/1‑71 (MQ=255) gatgaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGt < 1:636000/59‑1 (MQ=255) gatgaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGt < 1:3638062/59‑1 (MQ=255) atgaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCtat < 1:3021190/71‑1 (MQ=255) atgaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCta > 1:3737924/1‑70 (MQ=255) atgaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCta > 1:2027945/1‑70 (MQ=255) gaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACg < 1:3164883/65‑1 (MQ=255) gaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACg < 1:2802510/65‑1 (MQ=255) gaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCt < 1:1692341/67‑1 (MQ=255) gaAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTatat > 1:1177078/1‑71 (MQ=255) aaaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTatat < 1:3546426/70‑1 (MQ=255) aaaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATg < 1:1834311/71‑1 (MQ=255) aaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGc > 1:3522223/1‑64 (MQ=255) aaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGc < 1:2003968/71‑1 (MQ=255) aaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGc < 1:3151187/71‑1 (MQ=255) aaTCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGc < 1:1763340/71‑1 (MQ=255) tCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAg > 1:2149131/1‑71 (MQ=255) aaCACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCg < 1:2163313/71‑1 (MQ=255) acacCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTc < 1:1360423/50‑1 (MQ=255) cacCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTa < 1:3039182/71‑1 (MQ=255) acCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTaa < 1:1803082/71‑1 (MQ=255) tgatgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGAc > 1:3130538/1‑71 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgta < 1:2821860‑M1/70‑36 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgta < 1:2490003‑M1/70‑36 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcgggcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgta < 1:3704352‑M1/70‑36 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTaaa > 1:1670370/1‑65 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACt < 1:2185267/70‑1 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACt > 1:1516435/1‑70 (MQ=255) atgaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACt < 1:338542/70‑1 (MQ=255) atgaAGCTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACt < 1:378710/70‑1 (MQ=255) gaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTa < 1:2971463/61‑1 (MQ=255) gaAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTa < 1:498911/61‑1 (MQ=255) aaGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCAtt > 1:2429250/1‑71 (MQ=255) aaGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCAtt > 1:2485813/1‑71 (MQ=255) aGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTaaa > 1:3178848/1‑61 (MQ=255) tATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGa > 1:2393292/1‑61 (MQ=255) aTTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGAcc > 1:2049658/1‑70 (MQ=255) ttCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGc < 1:2108149/41‑1 (MQ=255) cTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAtt < 1:617305‑M2/71‑3 (MQ=255) ttAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgcccactt > 1:2275971‑M1/1‑23 (MQ=255) ttAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccact > 1:1933588‑M1/1‑23 (MQ=255) ttAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccact > 1:862524‑M1/1‑23 (MQ=255) ttAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtaca > 1:1286086‑M1/1‑23 (MQ=255) ttAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggacaatgagtcgtttaagctgcatatagcggaca > 1:2079745‑M1/1‑23 (MQ=255) aGCCTGATGGAAGGCCGTGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccactt < 1:2080740‑M1/68‑48 (MQ=255) aGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttca > 1:429310‑M2/1‑66 (MQ=255) aGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttc > 1:80940‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCgg < 1:2381198/71‑1 (MQ=255) tGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCgg > 1:1196393/1‑70 (MQ=255) gATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTaa > 1:1435779/1‑45 (MQ=255) gATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAAc > 1:3077342/1‑47 (MQ=255) gATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAAc > 1:2992916/1‑47 (MQ=255) gATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAAc > 1:2701471/1‑47 (MQ=255) gATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAAc > 1:2139716/1‑47 (MQ=255) gATGGAACGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCgg > 1:2431071/1‑69 (MQ=255) gAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCAtt > 1:2271889/1‑51 (MQ=255) gAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTg > 1:2366201/1‑52 (MQ=255) aaGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGcgcg > 1:2457457/1‑71 (MQ=255) aGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCgg < 1:3181079/71‑1 (MQ=255) aGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCgg < 1:975434/71‑1 (MQ=255) gCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCgg > 1:2881241/1‑69 (MQ=255) gCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCGGCa < 1:3082364/71‑1 (MQ=255) tGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccacttcacggccttccatcaggct > 1:429310‑M1/1‑4 (MQ=255) tGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgta < 1:1638972‑M1/39‑36 (MQ=255) tGAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatag > 1:3338148‑M1/1‑4 (MQ=255) gAAtcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccacttcacggccttccatcaggct > 1:80940‑M1/1‑3 (MQ=255) aatcggtcaatgagtcgtttacgctgcatatagcgtacattgaccacttcacggccttccatcaggctaag < 1:617305‑M1/71‑70 (MQ=255) aaGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttcacggccttccatcaggct < 1:2080740‑M2/68‑22 (MQ=255) aaGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCGGCAGAGAgc > 1:662412/1‑71 (MQ=255) aaGTGGGCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttcacggccttccatcaggctaa > 1:2275971‑M2/1‑47 (MQ=255) aGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttcacggccttccatcaggctaa > 1:1933588‑M2/1‑46 (MQ=255) aGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGAttcacggccttccatcaggctaa > 1:862524‑M2/1‑46 (MQ=255) | GAGAAAGGCCTGGTTGATGAAATCAACACCAGTGATGAAGTTATTCTTAGCCTGATGGAAGGCCGTGAAGTGGTCAATGTACGCTATATGCAGCGTAAACGACTCATTGACCGATTCACCGGCAGCGCGGCAGAGAGC > minE/869144‑869281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |