| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 1867538 = | 98 (1.660) | 6 (0.110) | 5/98 | NT | 5.8% | coding (1363/1455 nt) | ygcU | predicted FAD containing dehydrogenase |
| ? | minE | 1867566 = | 99 (1.750) | coding (1335/1455 nt) | ygcU | predicted FAD containing dehydrogenase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GTACCCGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAG > minE/1867468‑1867607 | gTACCCGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGcc > 1:896526/1‑71 (MQ=255)caagatcatctgtgaagaaaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatc > 1:2510070‑M1/71‑71 (MQ=255)caagatcatctgtgaagaaaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatc < 1:1973554‑M1/1‑1 (MQ=255) aagatcatctgtgaagaaaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCg > 1:425653‑M1/70‑71 (MQ=255) aagatcatctgtgaagaaaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCg > 1:1818344‑M1/70‑71 (MQ=255) ccGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCgtgt > 1:2832125/1‑71 (MQ=255) ccGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCgtgt > 1:1932271/1‑71 (MQ=255) ccGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCgtgt > 1:1791931/1‑71 (MQ=255) gTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTc < 1:1469238/71‑1 (MQ=255) gTATTCATAATGCCATTAGGATCGAAATGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTc < 1:837164/71‑1 (MQ=255) ttCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAg > 1:1064238/1‑71 (MQ=255) cATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGt < 1:1645432/70‑1 (MQ=255) cATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGt < 1:2833735/70‑1 (MQ=255) aTAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGtt < 1:2846416/70‑1 (MQ=255) aTAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGtt < 1:415863/70‑1 (MQ=255) aTAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGtt < 1:2256710/70‑1 (MQ=255) aaTGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTg > 1:2722116/1‑70 (MQ=255) aaTGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGc > 1:2334457/1‑71 (MQ=255) aTGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGc < 1:1791214/70‑1 (MQ=255) tGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTc < 1:1995217/71‑1 (MQ=255) ccATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCa < 1:2533551/71‑1 (MQ=255) ccATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCa < 1:632392/71‑1 (MQ=255) aaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTc < 1:3456599‑M1/17‑1 (MQ=255) aaccattcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTc < 1:2212740‑M1/17‑1 (MQ=255) aTTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGt < 1:1026338/71‑1 (MQ=255) tAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGt > 1:3317074/1‑69 (MQ=255) tAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTg > 1:1663832/1‑70 (MQ=255) tAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTg > 1:663166/1‑70 (MQ=255) attcgcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGa > 1:1984172‑M1/49‑71 (MQ=255) gcctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAAcgc > 1:2041132‑M1/45‑71 (MQ=255) aTCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAAcgc < 1:3590684/71‑1 (MQ=255) aTCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAAcgc < 1:1589871/71‑1 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCa < 1:944886/62‑1 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCa < 1:3286196/62‑1 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCa < 1:371988/62‑1 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGt > 1:3471444/1‑64 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAAcgcg < 1:2242324/71‑1 (MQ=255) tCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAAcgcg < 1:3183491/71‑1 (MQ=255) ctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGa > 1:3136248‑M1/43‑71 (MQ=255) gAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGt > 1:3201846/1‑62 (MQ=255) gAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGt > 1:858320/1‑62 (MQ=255) aaCTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATg < 1:573222/71‑1 (MQ=255) ggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCg < 1:364288‑M1/2‑1 (MQ=255) aCTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGt < 1:600043/71‑1 (MQ=255) ttttCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc > 1:3355617/1‑70 (MQ=255) ttttCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc > 1:646491/1‑70 (MQ=255) ttCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:1184726/1‑70 (MQ=255) tCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTc < 1:722737/37‑1 (MQ=255) tCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATa > 1:2595858/1‑71 (MQ=255) cccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGaa > 1:3134729/1‑50 (MQ=255) cccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgt < 1:588999/71‑1 (MQ=255) ttCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgt < 1:2686948/68‑1 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTg > 1:2776503/1‑36 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2791487/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2145642/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:3267564/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg > 1:2030132/1‑71 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg > 1:1076796/1‑71 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtgg > 1:2810526/1‑71 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:3351247/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:793738/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:2893496/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:784878/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggt < 1:2041604/69‑1 (MQ=255) cAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtggt > 1:1880139/1‑71 (MQ=255) cAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:2055401/69‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:1361217/52‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:2600568/52‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:1158732/52‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:1761862/52‑1 (MQ=255) aCGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:3174815/64‑1 (MQ=255) 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ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCg < 1:246132/71‑1 (MQ=255) cACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGa < 1:2991641/71‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:954359/66‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:3002824/66‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGaa < 1:844073/71‑1 (MQ=255) cgcgCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATAc > 1:558881/1‑50 (MQ=255) cgcgCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:698203/65‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGAGTTCCAGTTTGCTCCAGAGAAGGCGATGTTTACAGATACCgtggtg > 1:765877/1‑56 (MQ=255) cgcTGCCGTGTTCGAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc < 1:2547307/43‑1 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:44035/1‑43 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2475723/1‑43 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:1701521/1‑43 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:791468/71‑1 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:1822975/71‑1 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:1561921/71‑1 (MQ=255) cTGCCGTGTTACAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2799134/1‑43 (MQ=255) tGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:3621300/52‑1 (MQ=255) tGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtgg > 1:2146559/1‑50 (MQ=255) ccGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAg > 1:731433/1‑71 (MQ=255) | GTACCCGTATTCATAATGCCATTAGGATCGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAG > minE/1867468‑1867607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |