| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 1867538 = | 98 (1.660) | 6 (0.110) | 5/98 | NT | 5.8% | coding (1363/1455 nt) | ygcU | predicted FAD containing dehydrogenase |
| ? | minE | 1867566 = | 99 (1.750) | coding (1335/1455 nt) | ygcU | predicted FAD containing dehydrogenase | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTG > minE/1867496‑1867635 | ctcggcggttcgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGa > 1:3136248‑M1/43‑71 (MQ=255) aaCTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATg < 1:573222/71‑1 (MQ=255) aCTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGt < 1:600043/71‑1 (MQ=255) cTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt > 1:2823103/1‑71 (MQ=255) gCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGttt > 1:2663700/1‑70 (MQ=255) ttttCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc > 1:646491/1‑70 (MQ=255) cgatggtgcaccaccacggtatcggtaaacatCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGAt < 1:2386821‑M1/30‑1 (MQ=255) ttCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:1184726/1‑70 (MQ=255) tCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATa > 1:2595858/1‑71 (MQ=255) cccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgt > 1:2783555/1‑71 (MQ=255) cTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc < 1:1793207/61‑1 (MQ=255) ttCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgt < 1:2686948/68‑1 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2145642/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:3267564/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:2791487/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:739155/1‑61 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg > 1:2030132/1‑71 (MQ=255) tCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg > 1:1076796/1‑71 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtgg > 1:2810526/1‑71 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:3351247/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:784878/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:793738/70‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:2893496/70‑1 (MQ=255) cAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtggt > 1:1880139/1‑71 (MQ=255) cAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtgg < 1:628308/70‑1 (MQ=255) cAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:2055401/69‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:2600568/52‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:1761862/52‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGtt < 1:1725888/52‑1 (MQ=255) cAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCa < 1:835117/71‑1 (MQ=255) cGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa > 1:1167148/1‑71 (MQ=255) cGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:2397275/71‑1 (MQ=255) gCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCAt > 1:307837/1‑71 (MQ=255) gCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCAt < 1:3420180/71‑1 (MQ=255) gCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCAt > 1:365979/1‑71 (MQ=255) cccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc < 1:3575714/71‑1 (MQ=255) cccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc < 1:107460/71‑1 (MQ=255) cccACGCGCAGCAGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATAcc > 1:3625417/1‑55 (MQ=255) ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc < 1:2190987/70‑1 (MQ=255) ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc < 1:2616922/70‑1 (MQ=255) ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc > 1:2001429/1‑70 (MQ=255) ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCg < 1:246132/71‑1 (MQ=255) ccACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCg < 1:2480585/71‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:3002824/66‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGaa < 1:844073/71‑1 (MQ=255) cgcgCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATAc > 1:558881/1‑50 (MQ=255) cgcgCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCa < 1:698203/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGTGTTCGAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTAcc < 1:2547307/43‑1 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:1701521/1‑43 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGa > 1:44035/1‑43 (MQ=255) cTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:791468/71‑1 (MQ=255) tGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCgtggtg < 1:3621300/52‑1 (MQ=255) tcgcgttcactggagcaaactggaacacgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAg > 1:3136248‑M2/30‑71 (MQ=255) ccGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAg > 1:731433/1‑71 (MQ=255) gcgttcactggagcaaactggaacacgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGc > 1:2041132‑M2/28‑71 (MQ=255) tgtTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGc > 1:383283/1‑70 (MQ=255) tgtTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGc > 1:1109319/1‑70 (MQ=255) tgtTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGc > 1:3482680/1‑70 (MQ=255) ttCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATAcc < 1:1307802/39‑1 (MQ=255) tcactggagcaaactggaacacgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAAt > 1:1984172‑M2/24‑71 (MQ=255) ccAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAc > 1:2694069/1‑57 (MQ=255) ccAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGaa > 1:1677622/1‑69 (MQ=255) ccAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGaa > 1:3698628/1‑69 (MQ=255) aGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCg > 1:918592/1‑65 (MQ=255) aGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCg > 1:1466876/1‑65 (MQ=255) gTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGtt > 1:1881895/1‑71 (MQ=255) gTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGtt > 1:3035353/1‑71 (MQ=255) tttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGa < 1:900350/59‑1 (MQ=255) tttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGa < 1:1222107/59‑1 (MQ=255) tttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGa < 1:1891428/59‑1 (MQ=255) ttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCTCCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTttc > 1:2821436/1‑71 (MQ=255) ttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATc > 1:341104/1‑48 (MQ=255) ttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTttc > 1:1263399/1‑71 (MQ=255) ttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTttc > 1:2107204/1‑71 (MQ=255) gagcaaactggaacacgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGtt < 1:2212740‑M2/52‑1 (MQ=255) gagcaaactggaacacgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGtt < 1:3456599‑M2/52‑1 (MQ=255) cTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTttctt < 1:3187183/70‑1 (MQ=255) cAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGttt < 1:2890998/64‑1 (MQ=255) cAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTca < 1:3018640/69‑1 (MQ=255) aGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCAc < 1:861382/37‑1 (MQ=255) aGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAg < 1:477556/71‑1 (MQ=255) gTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGaa < 1:1123630/43‑1 (MQ=255) gTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTttcttc > 1:1380705/1‑66 (MQ=255) tGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAgat > 1:1535114/1‑71 (MQ=255) aaCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:3505753/45‑1 (MQ=255) aaCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAccgcc < 1:1995243/45‑1 (MQ=255) aaCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAgatga > 1:3726942/1‑71 (MQ=255) aaCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAgatga > 1:1118081/1‑71 (MQ=255) aCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAc > 1:292705/1‑40 (MQ=255) aCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAAc > 1:953724/1‑40 (MQ=255) aCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAgat > 1:975784/1‑68 (MQ=255) aCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAgat > 1:980070/1‑68 (MQ=255) cgcgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATc > 1:2419082/1‑71 (MQ=255) gcgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAga < 1:1034516/65‑1 (MQ=255) cgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCtt > 1:425653‑M2/3‑71 (MQ=255) cgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCtt > 1:1818344‑M2/3‑71 (MQ=255) cgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCtt > 1:3638767‑M2/3‑71 (MQ=255) gATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTg > 1:1349928‑M2/2‑71 (MQ=255) gATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTg > 1:2510070‑M2/2‑71 (MQ=255) gATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTg < 1:1973554‑M2/70‑1 (MQ=255) | CGAACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTG > minE/1867496‑1867635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |