| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2581882 = | 88 (1.490) | 7 (0.130) | 4/92 | NT | 9.2% | coding (3/825 nt) | gadX | DNA‑binding transcriptional dual regulator |
| ? | minE | 2581912 = | 59 (1.110) | coding (33/825 nt) | gadX | DNA‑binding transcriptional dual regulator | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGG > minE/2581815‑2581950 | gtcaccgccattaaaatagcgatattcaccattaaccatggtgagaatatatttatgtcttgcatacGCaa < 1:2100782‑M1/4‑1 (MQ=255)gtcaccgccattaaaatagcgatattcaccattaaccatggtgagaatatatttatgtcttgcatacGCaa < 1:2051956‑M1/4‑1 (MQ=255) tcaccgccattaaaatagcgatattcaccattaaccatggtgagaatatatttatgtcttgcatacGCAAt < 1:1701463‑M1/5‑1 (MQ=255) tcaccgccattaaaatagcgatattcaccattaaccatggtgagaacatatttatgtcttgcatacGCAAt < 1:496537‑M1/5‑1 (MQ=255) cTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCa > 1:1039478/1‑71 (MQ=255) ttAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCAc > 1:2357581/1‑71 (MQ=255) aaGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTa > 1:58214/1‑71 (MQ=255) agagGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACt < 1:2463248/69‑1 (MQ=255) agagGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTa > 1:1059204/1‑70 (MQ=255) agagGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTa > 1:2582360/1‑70 (MQ=255) gagGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCa > 1:3360406/1‑66 (MQ=255) agGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTAc < 1:793292/69‑1 (MQ=255) agGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:1877696/71‑1 (MQ=255) agGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:1269714/71‑1 (MQ=255) agGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:1157788/71‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:2974083/70‑1 (MQ=255) ggcggcGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATgg > 1:37274/1‑71 (MQ=255) cggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGa < 1:1457735/71‑1 (MQ=255) ggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGaa < 1:2987856/71‑1 (MQ=255) ggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGaa > 1:2008268/1‑71 (MQ=255) ggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGaa > 1:3201826/1‑71 (MQ=255) ggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGaa < 1:48495/71‑1 (MQ=255) gcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAAt > 1:853725/1‑71 (MQ=255) gcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAAt > 1:3303574/1‑71 (MQ=255) cgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAAtt < 1:639200/71‑1 (MQ=255) tGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTg > 1:3381452/1‑70 (MQ=255) tGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGt > 1:3301903/1‑71 (MQ=255) tGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGt > 1:968680/1‑71 (MQ=255) tGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGt > 1:1094937/1‑71 (MQ=255) atattcaccattaaccatggtgagaatatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCt < 1:3178299‑M1/24‑1 (MQ=255) aCATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTc > 1:3331854/1‑68 (MQ=255) aCATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTaa > 1:577971/1‑71 (MQ=255) cATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTaa < 1:2757598/70‑1 (MQ=255) aTTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt > 1:769359/1‑71 (MQ=255) aTTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt > 1:538003/1‑71 (MQ=255) taataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAAt > 1:3197802/1‑46 (MQ=255) taataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAAt > 1:2694135/1‑46 (MQ=255) taataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAAt > 1:545851/1‑46 (MQ=255) taataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCAc > 1:1484752/1‑49 (MQ=255) ataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCg > 1:2807007/1‑70 (MQ=255) ataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCg < 1:2353722/70‑1 (MQ=255) ataaACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCg > 1:1023009/1‑70 (MQ=255) cAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATg > 1:2674279/1‑48 (MQ=255) cAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATg > 1:3462239/1‑48 (MQ=255) cAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATg > 1:574831/1‑48 (MQ=255) cAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGc > 1:1881110/1‑70 (MQ=255) gTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGc > 1:3713239/1‑68 (MQ=255) atatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACa > 1:431043/1‑71 (MQ=255) atatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACa > 1:3104690/1‑71 (MQ=255) atatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACa > 1:671751/1‑71 (MQ=255) tatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACa < 1:2360082/70‑1 (MQ=255) tgagaatatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt < 1:3439932‑M1/28‑1 (MQ=255) tgagaatatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt < 1:848252‑M1/28‑1 (MQ=255) tGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGc > 1:2104222/1‑62 (MQ=255) tGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGc > 1:1134648/1‑62 (MQ=255) tGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATa > 1:2907823/1‑70 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:392192/38‑1 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:2830149/38‑1 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:2845148/38‑1 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:3432271/38‑1 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACAt < 1:116618/38‑1 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTa > 1:3211124/1‑58 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTa > 1:2523453/1‑58 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTa > 1:3430804/1‑58 (MQ=255) gTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTa > 1:3237735/1‑58 (MQ=255) tttATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt < 1:1476090/52‑1 (MQ=255) tttATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt < 1:537504/52‑1 (MQ=255) aatatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt > 1:2733048‑M1/23‑50 (MQ=255) tatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGc < 1:706340‑M1/30‑1 (MQ=255) tatatttatgtcttgcatacGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGc < 1:1789706‑M1/30‑1 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATtc < 1:1950362/71‑1 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATtc < 1:1069993/71‑1 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATtc < 1:3732927/71‑1 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATtc < 1:383459/71‑1 (MQ=255) tatTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTg > 1:2535622/1‑44 (MQ=255) tatTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTg > 1:789152/1‑44 (MQ=255) tatTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTg > 1:2030833/1‑44 (MQ=255) tatTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCa > 1:3317613/1‑71 (MQ=255) ttAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTaa < 1:3452214/39‑1 (MQ=255) ttAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTaa < 1:604013/39‑1 (MQ=255) aGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCAt < 1:644761/70‑1 (MQ=255) aGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCAt < 1:1784434/70‑1 (MQ=255) gTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATgg > 1:971198/1‑71 (MQ=255) tCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAAtt < 1:3136008/36‑1 (MQ=255) tCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGt < 1:3272922/71‑1 (MQ=255) tCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGt < 1:2796801/71‑1 (MQ=255) tCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGt > 1:2361129/1‑71 (MQ=255) cAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATtctc < 1:1319861/62‑1 (MQ=255) aaCTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGtt > 1:1135343/1‑70 (MQ=255) aaCTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGt > 1:547992/1‑69 (MQ=255) aaCTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTa < 1:3632797/71‑1 (MQ=255) aaCTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTa < 1:1907191/71‑1 (MQ=255) aCTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTaa < 1:176000/71‑1 (MQ=255) cTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACAt < 1:1133837/47‑1 (MQ=255) cTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAAt > 1:984746/1‑71 (MQ=255) cTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAAt > 1:818805/1‑71 (MQ=255) cTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAAt > 1:3155442/1‑71 (MQ=255) aTGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATaa > 1:837144/1‑47 (MQ=255) aTGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATgg > 1:3309958/1‑71 (MQ=255) aTGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATgg > 1:233928/1‑71 (MQ=255) | TGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGG > minE/2581815‑2581950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |