| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2602170 = | 56 (0.950) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 6.0% | coding (1821/2043 nt) | prlC | oligopeptidase A |
| ? | minE | 2602216 = | 77 (1.480) | coding (1867/2043 nt) | prlC | oligopeptidase A | |||||
CGTGGTGCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTGAGG > minE/2602104‑2602237 | gtcgaggaacgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGcc > 1:3452626‑M1/67‑70 (MQ=255)gtcgaggaacgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGcc > 1:3119930‑M1/67‑70 (MQ=255)gtcgaggaacgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGcc > 1:2270822‑M1/67‑70 (MQ=255) tcgaggaacgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGc < 1:285829‑M1/6‑1 (MQ=255) cgaggaacgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGc < 1:603705‑M1/6‑1 (MQ=255) ggtgCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAg > 1:1952198/1‑71 (MQ=255) gtgCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAgg > 1:1042561/1‑71 (MQ=255) gtgCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAgg > 1:2974708/1‑71 (MQ=255) tgCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGt < 1:2175560/71‑1 (MQ=255) tgCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGt < 1:1468900/71‑1 (MQ=255) ccATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGtt > 1:2048331/1‑70 (MQ=255) cATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtac > 1:947499/1‑71 (MQ=255) acgactgcccggtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatct < 1:1905384‑M1/1‑1 (MQ=255) aTCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtact < 1:1970428/71‑1 (MQ=255) aTCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtac > 1:3180350/1‑70 (MQ=255) ctcCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:1442696/1‑70 (MQ=255) tcCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:3657918/1‑69 (MQ=255) tcCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:1117710/1‑69 (MQ=255) tcCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:2864213/1‑69 (MQ=255) tcCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:3653658/1‑69 (MQ=255) cGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCa > 1:1352381/1‑59 (MQ=255) cGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCa > 1:3646568/1‑59 (MQ=255) cGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:726429/1‑67 (MQ=255) gTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCt < 1:544747/71‑1 (MQ=255) tCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTa > 1:257963/1‑71 (MQ=255) cTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATg > 1:2984396/1‑50 (MQ=255) cTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATg > 1:2881619/1‑50 (MQ=255) cTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTAc < 1:571633/70‑1 (MQ=255) gtttcacggttgaaaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCt < 1:2140700‑M1/24‑1 (MQ=255) ggCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCtgtg > 1:539879/1‑71 (MQ=255) ggCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCtgtg < 1:3262418/71‑1 (MQ=255) gTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGcc > 1:1038753/1‑44 (MQ=255) gTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGcc > 1:658556/1‑44 (MQ=255) gTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGcc > 1:1842166/1‑44 (MQ=255) gTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCt < 1:1032082/60‑1 (MQ=255) tttCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTg < 1:1081806/71‑1 (MQ=255) ttCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTAc > 1:3255106/1‑60 (MQ=255) tCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCa > 1:61827/1‑44 (MQ=255) tCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAg > 1:3659299/1‑45 (MQ=255) tCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAg > 1:659078/1‑45 (MQ=255) tCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAg > 1:331477/1‑45 (MQ=255) tCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGAc > 1:557102/1‑71 (MQ=255) cccGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACg > 1:3401190/1‑71 (MQ=255) ccGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCtgtg > 1:1301543/1‑62 (MQ=255) ccGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCtgtg > 1:3465286/1‑62 (MQ=255) aaatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTa < 1:1997592‑M1/37‑1 (MQ=255) ggaCGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTAc > 1:2605480/3‑55 (MQ=255) gCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTAc < 1:2385181/71‑1 (MQ=255) aatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTAc < 1:206416‑M1/38‑1 (MQ=255) aatgccctcttcctcaaagcgcgagaaagcatcTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTAc < 1:210008‑M1/38‑1 (MQ=255) cACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACt > 1:3619371/1‑71 (MQ=255) gCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTggc > 1:2761009/1‑71 (MQ=255) gCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTggc > 1:3426345/1‑71 (MQ=255) cTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTggcg < 1:1935690/71‑1 (MQ=255) tttCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtac > 1:2350678/1‑40 (MQ=255) tttCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCt < 1:2588198/47‑1 (MQ=255) tttCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTggcgg > 1:262065/1‑71 (MQ=255) cAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTggcgg > 1:71175/1‑68 (MQ=255) aGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtactac > 1:1350610/1‑39 (MQ=255) aGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtactac > 1:2646144/1‑39 (MQ=255) gCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGAt < 1:3170015/71‑1 (MQ=255) ccATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:1360296/1‑36 (MQ=255) ccATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:1889929/1‑36 (MQ=255) ccATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTtacta > 1:157051/1‑36 (MQ=255) ttttCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTtc < 1:1844854/71‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTtctc > 1:392926/1‑71 (MQ=255) ttCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTtctc > 1:370306/1‑71 (MQ=255) ttCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTtctc > 1:35115/1‑71 (MQ=255) gtggtTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCttt > 1:1045682/1‑71 (MQ=255) tggtTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTg < 1:329488/71‑1 (MQ=255) tggtTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTg < 1:2729299/71‑1 (MQ=255) ggtTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCttt > 1:665002/1‑69 (MQ=255) aTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTGAgg > 1:3102014/1‑69 (MQ=255) aTGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTGAgg > 1:1087352/1‑69 (MQ=255) | CGTGGTGCCATCTCCGTCCTGGGGCCGTTTCCCGCACGCTTTCAGCCATATTTTCGCCGGTGGTTATGCCGCAGGTTACTACAGCTACCTGTGGGCTGACGTACTGGCGGCAGATGCTTTCTCGCGCTTTGAGG > minE/2602104‑2602237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |