New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | minE | 2794500 = | 63 (1.070) | 5 (0.090) | 3/92 | NT | 8.9% | coding (841/2424 nt) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
? | minE | 2794521 = | 45 (0.850) | coding (820/2424 nt) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
GGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTC > minE/2794430‑2794570 | ctgatggaagagattgcggcgaatttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcac > 1:1041372‑M1/71‑71 (MQ=255) ctgatggaagagattgcggcgaatttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcac > 1:1127982‑M1/71‑71 (MQ=255) ctgatggaagagattgcggcgaatttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcac > 1:1210210‑M1/71‑71 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGccc < 1:2343404/64‑1 (MQ=255) aCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaaa < 1:939715/70‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaaa < 1:2248965/69‑1 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGCCGTTGATGCCCTGGTAAAGTc > 1:118939/1‑71 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTc > 1:2258335/1‑71 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg < 1:3711677/71‑1 (MQ=255) gCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCgg > 1:1156681/1‑71 (MQ=255) gCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg > 1:1659828/1‑70 (MQ=255) cTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGt > 1:2231797/1‑71 (MQ=255) cATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTg > 1:265544/1‑58 (MQ=255) aTGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt < 1:2393779/69‑1 (MQ=255) aTGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt < 1:2289514/69‑1 (MQ=255) aTGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc < 1:3532296/70‑1 (MQ=255) aTGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc < 1:3093390/70‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCa < 1:2090411/71‑1 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAg > 1:617155/1‑71 (MQ=255) cgaatttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCTGGTAAAGTCGGTTCCAg > 1:1596676‑M1/52‑71 (MQ=255) cgaatttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCTGGTAAAGTCGGTTCCAg > 1:2621451‑M1/52‑71 (MQ=255) atttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTg > 1:356745‑M1/49‑71 (MQ=255) tttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTg > 1:1582567‑M1/48‑70 (MQ=255) gtcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaa < 1:388486/55‑1 (MQ=255) gtcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGa < 1:2537896/71‑1 (MQ=255) ttctcttacgagatgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCTGGTAAAGTCGGTTcc > 1:482668‑M1/47‑64 (MQ=255) tcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGt < 1:2616606/57‑1 (MQ=255) tcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGt < 1:1021245/57‑1 (MQ=255) tcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGt < 1:1328422/57‑1 (MQ=255) tcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTcc < 1:596410/64‑1 (MQ=255) cgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAg > 1:420576/1‑71 (MQ=255) gtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGc > 1:1074364/1‑71 (MQ=255) gtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGc > 1:519108/1‑71 (MQ=255) gtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGc > 1:293080/1‑71 (MQ=255) ccAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTa < 1:3253639/46‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGaa > 1:1491601/1‑71 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGaa > 1:723953/1‑70 (MQ=255) gCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATa < 1:1853169/71‑1 (MQ=255) atgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCt > 1:2519368‑M1/35‑37 (MQ=255) atgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCt > 1:755219‑M1/35‑37 (MQ=255) atgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCt > 1:599903‑M1/35‑37 (MQ=255) atgattcgcctgactgaccgtattctgggcttcaCCt > 1:2515149‑M1/35‑37 (MQ=255) ggCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt > 1:1613255/1‑49 (MQ=255) ggCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACgg > 1:568607/1‑71 (MQ=255) ggCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACgg > 1:3317202/1‑71 (MQ=255) gCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTgg < 1:93191/37‑1 (MQ=255) gCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGGTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACg < 1:1566570/69‑1 (MQ=255) gAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTg < 1:1174336/53‑1 (MQ=255) aCGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagt < 1:486346/71‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagt > 1:723556/1‑70 (MQ=255) gcgcTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca < 1:811937/71‑1 (MQ=255) gcgcTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca < 1:151877/71‑1 (MQ=255) gcTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAgg > 1:2892728/1‑71 (MQ=255) cTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGc < 1:1813720/71‑1 (MQ=255) cTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGc < 1:1215423/71‑1 (MQ=255) tCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGcc < 1:746075/50‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGa > 1:2540492/1‑53 (MQ=255) cAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGa > 1:238661/1‑53 (MQ=255) cGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAat > 1:2468515/1‑70 (MQ=255) cGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAat > 1:1562089/1‑70 (MQ=255) ttATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGc < 1:1892541/64‑1 (MQ=255) tATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtc < 1:928069/55‑1 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAgg > 1:420441/1‑35 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAgg > 1:2435981/1‑35 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAgg > 1:3433559/1‑35 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAgg > 1:704923/1‑35 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc < 1:3611310/70‑1 (MQ=255) aTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc < 1:1693482/70‑1 (MQ=255) aCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:867237/1‑55 (MQ=255) aCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:2974075/1‑55 (MQ=255) aCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:1632543/1‑55 (MQ=255) aCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:3017446/1‑55 (MQ=255) aCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:2988919/1‑55 (MQ=255) cGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGt > 1:3192771/1‑69 (MQ=255) cGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa < 1:2805242/71‑1 (MQ=255) gTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGt > 1:3042023/1‑68 (MQ=255) ttGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc < 1:2989054/63‑1 (MQ=255) ttGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc < 1:3584931/63‑1 (MQ=255) tGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaaa < 1:2767427/71‑1 (MQ=255) gCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAt > 1:1859848/1‑71 (MQ=255) cccTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa < 1:2730741/63‑1 (MQ=255) cccTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa < 1:300421/63‑1 (MQ=255) CCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTc > 1:2615687‑M1/1‑71 (MQ=255) | GGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTC > minE/2794430‑2794570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |