| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1102207 | 105 (1.780) | 7 (0.130) | 5/92 | NT | 6.3% | coding (728/867 nt) | ydiB | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| ? | minE | = 1102226 | 113 (2.120) | coding (747/867 nt) | ydiB | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCA > minE/1102156‑1102296 | gACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGt < 1:1891850/71‑1 (MQ=255) aCTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTt > 1:217537‑M2/1‑70 (MQ=255) cTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgca < 1:154421‑M2/70‑5 (MQ=255) cTGCTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgca < 1:2812856‑M2/70‑5 (MQ=255) ggTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCaaaa > 1:1899104/1‑71 (MQ=255) gTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgcaa > 1:228338‑M2/1‑63 (MQ=255) gTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgcaa > 1:1165351‑M2/1‑63 (MQ=255) gTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgcaa > 1:403530‑M2/1‑63 (MQ=255) gTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAAc > 1:170764/1‑71 (MQ=255) aCTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGa < 1:2101050/70‑1 (MQ=255) tGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGAtt > 1:661147/1‑70 (MQ=255) aaTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAAc < 1:1243804/64‑1 (MQ=255) aaTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGAt > 1:239937/1‑71 (MQ=255) aaTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGAt > 1:1522546/1‑71 (MQ=255) aTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATg < 1:2146374/71‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATgg < 1:3309387/71‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATg > 1:1984107/1‑70 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATg > 1:2551118/1‑70 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATg > 1:1133321/1‑70 (MQ=255) gtgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGa > 1:1200860/1‑69 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATAc < 1:1243118/71‑1 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATAc < 1:1108550/71‑1 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATAc < 1:889102/71‑1 (MQ=255) gtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACg > 1:454498/1‑71 (MQ=255) gtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACg > 1:2816478/1‑71 (MQ=255) tataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACgg > 1:158594/1‑71 (MQ=255) tataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACgg > 1:2421635/1‑71 (MQ=255) tataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACg < 1:631882/70‑1 (MQ=255) ataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGa > 1:981850/1‑57 (MQ=255) taACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCa > 1:3211608/1‑71 (MQ=255) aaCCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAt > 1:429537/1‑71 (MQ=255) cccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGAt > 1:1802527/1‑58 (MQ=255) cccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgt > 1:2924160/1‑71 (MQ=255) cccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgt > 1:2182547/1‑71 (MQ=255) cGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGAtt < 1:3032078/53‑1 (MQ=255) cGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGAtt < 1:626483/53‑1 (MQ=255) gCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGa < 1:505996/50‑1 (MQ=255) gCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgt > 1:2643953/1‑71 (MQ=255) gCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgt > 1:1475294/1‑71 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgttg < 1:3365658/71‑1 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgttg < 1:146436/71‑1 (MQ=255) atGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTtgtg > 1:1049368/1‑71 (MQ=255) tGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCagg > 1:24745/1‑60 (MQ=255) tGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtg > 1:1935335/1‑62 (MQ=255) tGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATAGATACGGCAtg > 1:1218551/1‑62 (MQ=255) aCGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGc > 1:1999339/1‑70 (MQ=255) cGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATg > 1:1316740/1‑48 (MQ=255) cGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGc > 1:828345/1‑69 (MQ=255) gAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAg < 1:522536/71‑1 (MQ=255) gAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAg < 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1:3445449/1‑36 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGa > 1:2682606/1‑36 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATa > 1:495389/1‑46 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATa > 1:1605995/1‑46 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACgg > 1:2334832/1‑49 (MQ=255) aTTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgt < 1:2976018/53‑1 (MQ=255) aTTGAAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgt < 1:108636/53‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgcaataacttcgtcatatgcgggttatacacgcattcagtgaccag > 1:1625977‑M2/1‑24 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTtgcaataacttcgtcatatgcgggttatacacgcattcagtgac < 1:294273‑M2/68‑45 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgt < 1:1682042/52‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCaa > 1:1868838/1‑63 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCaa > 1:3705925/1‑63 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCa > 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gcgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCa < 1:94294/53‑1 (MQ=255) cgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTcac > 1:1648054/1‑70 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgttgt > 1:3492508/1‑47 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAg > 1:562839/1‑53 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAg > 1:554509/1‑53 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAg > 1:493762/1‑53 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAt > 1:3298168/1‑71 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAt > 1:2657991/1‑71 (MQ=255) aacaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAt < 1:464395/37‑1 (MQ=255) aacaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAgg < 1:1033653/52‑1 (MQ=255) acaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAt > 1:22355/1‑68 (MQ=255) caaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCaa > 1:676857/1‑48 (MQ=255) caaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCaa > 1:190301/1‑48 (MQ=255) gCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGc < 1:1872887/50‑1 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGc > 1:2575421/1‑46 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTgg > 1:914593/1‑70 (MQ=255) | GACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCA > minE/1102156‑1102296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |