| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1975203 | 54 (0.920) | 8 (0.160) | 5/88 | NT | 13.8% | intergenic (+349/‑75) | metK/galP | methionine adenosyltransferase 1/D‑galactose transporter |
| ? | minE | = 1975209 | 53 (1.040) | intergenic (+355/‑69) | metK/galP | methionine adenosyltransferase 1/D‑galactose transporter | |||||
ATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCAT > minE/1975139‑1975276 | attattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCt > 1:2839277/1‑71 (MQ=255) ttattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCt < 1:3141995/70‑1 (MQ=255) ttattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCt > 1:421468/1‑70 (MQ=255) ttattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTt < 1:1518405‑M2/71‑2 (MQ=255) attTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtca < 1:624401‑M2/71‑4 (MQ=255) attTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtca < 1:1581128‑M2/71‑4 (MQ=255) attTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtc > 1:450270‑M2/1‑68 (MQ=255) ttttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtcac > 1:306606‑M2/1‑67 (MQ=255) ttttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtca < 1:3450576‑M2/70‑4 (MQ=255) ttttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtca < 1:3296693‑M2/70‑4 (MQ=255) ttttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtca < 1:3670530‑M2/70‑4 (MQ=255) ttttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTtc > 1:445980‑M2/1‑67 (MQ=255) tCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTt < 1:668662‑M2/65‑2 (MQ=255) aTGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCt < 1:2988689/70‑1 (MQ=255) cACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:3117581/71‑1 (MQ=255) cACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:1784196/71‑1 (MQ=255) cACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:193060/71‑1 (MQ=255) cACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCtttt < 1:2703026/70‑1 (MQ=255) agttATATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:732541/68‑1 (MQ=255) aCTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:355715/70‑1 (MQ=255) aCTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTa < 1:482129/71‑1 (MQ=255) aCTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTa > 1:1699647/1‑71 (MQ=255) cTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGTTTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCttttt < 1:2929622/69‑1 (MQ=255) ttAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcg > 1:2229850/1‑71 (MQ=255) tAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAc > 1:386036/1‑69 (MQ=255) tAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCCTTTTAcgt > 1:2475212/1‑71 (MQ=255) aaaTCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCt > 1:3164424/1‑54 (MQ=255) aaaTCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAc < 1:283163/68‑1 (MQ=255) aaTCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcatcg > 1:2931107/1‑71 (MQ=255) tCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcgtcgt > 1:60737/1‑70 (MQ=255) tAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACt > 1:3130392/1‑70 (MQ=255) tAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACt > 1:1247463/1‑70 (MQ=255) tAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCAcc > 1:1560350/1‑70 (MQ=255) tAAGATAAATGTTAGCGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCAcc > 1:1264269/1‑70 (MQ=255) aGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt > 1:1859265/1‑71 (MQ=255) aGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt > 1:3419426/1‑71 (MQ=255) aGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt > 1:1223429/1‑71 (MQ=255) aTAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCtttt < 1:869001/51‑1 (MQ=255) aTAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCtttt < 1:1245255/51‑1 (MQ=255) tGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAAtt < 1:2758386/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCtttt < 1:3246647/38‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcg < 1:2493740/42‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcg < 1:2232152/42‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcg < 1:1726795/42‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaa < 1:2841148/71‑1 (MQ=255) tAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaa < 1:106093/71‑1 (MQ=255) aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcgtc > 1:658021/1‑42 (MQ=255) aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCtt > 1:35897/1‑57 (MQ=255) aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCtt > 1:1605480/1‑57 (MQ=255) gCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaaaaa < 1:9624/71‑1 (MQ=255) gCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaaaaa < 1:2244014/71‑1 (MQ=255) gcttACACTGATGTGATTTGCTTGACATCTTTTTACGTCGTACTCACCt > 1:2297719/3‑49 (MQ=255) gcttACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCt > 1:2381249/3‑49 (MQ=255) gATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAAt < 1:291026/71‑1 (MQ=255) gATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAAt < 1:3737039/71‑1 (MQ=255) ttACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATaa < 1:2343082/71‑1 (MQ=255) ttACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATaa < 1:1505904/71‑1 (MQ=255) ttACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATaa > 1:972557/1‑71 (MQ=255) acacTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTAcgtcg < 1:1218070/36‑1 (MQ=255) cacTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgtttacactaacatttatcttagttatgatttaagtg < 1:660008‑M2/70‑54 (MQ=255) cacTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagttatgatttaagtg > 1:2565652‑M2/1‑17 (MQ=255) cacTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagttatgatttaagtg > 1:2801377‑M2/1‑17 (MQ=255) cacTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagttatgatttaagtg < 1:2925221‑M2/70‑54 (MQ=255) cacTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATaa > 1:3198981/1‑68 (MQ=255) acTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagtt > 1:2981804‑M2/1‑16 (MQ=255) acTGATGTGATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagtt > 1:1684537‑M2/1‑16 (MQ=255) cTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCata < 1:893036/71‑1 (MQ=255) tGATGTGATTTGCTTTACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCatat > 1:1305486/1‑71 (MQ=255) aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTg > 1:737270/1‑71 (MQ=255) aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTg > 1:42637/1‑71 (MQ=255) tgtgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTc < 1:3646910/48‑1 (MQ=255) tgtgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTc < 1:3289662/48‑1 (MQ=255) tgtgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTc < 1:3045222/48‑1 (MQ=255) tgtgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTgg < 1:3185847/71‑1 (MQ=255) tgATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagttatgatttaagtgcatgaaaat > 1:3557599‑M2/1‑9 (MQ=255) gATTTGCTtcacatcagtgtaatcgcttacactaacatttatcttagttat > 1:1285722‑M2/1‑8 (MQ=255) gATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt < 1:480737/37‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt < 1:160130/37‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTAt < 1:2329061/37‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAgg > 1:3732684/1‑71 (MQ=255) aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAggg < 1:2498839/71‑1 (MQ=255) aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAggg > 1:1377193/1‑71 (MQ=255) aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAgg < 1:417848/70‑1 (MQ=255) aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAgg < 1:927251/70‑1 (MQ=255) tttGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATAtt > 1:3389638/1‑64 (MQ=255) tttGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAggg > 1:2979116/1‑70 (MQ=255) ttGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATa < 1:3012662/55‑1 (MQ=255) gCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCat > 1:3400744/1‑58 (MQ=255) gCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCat > 1:1063908/1‑58 (MQ=255) gCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGcat < 1:3323533/70‑1 (MQ=255) ttCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaaaa < 1:2386465/47‑1 (MQ=255) ttCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATaaaa < 1:159997/47‑1 (MQ=255) | ATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCAT > minE/1975139‑1975276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |