| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2313413 | 43 (0.730) | 7 (0.140) | 3/88 | NT | 14.9% | intergenic (‑23/‑402) | yiiU/glpF | conserved hypothetical protein/glycerol facilitator |
| ? | minE | = 2313447 | 43 (0.840) | intergenic (‑57/‑368) | yiiU/glpF | conserved hypothetical protein/glycerol facilitator | |||||
ATGACATTGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTGTCCAG > minE/2313378‑2313515 | aTGACATTGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTg < 1:1787545/70‑1 (MQ=255) aCATTGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgc < 1:1983591‑M2/71‑5 (MQ=255) ttGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcct < 1:2377178‑M2/70‑7 (MQ=255) ttGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcct < 1:2297027‑M2/70‑7 (MQ=255) tGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcctt < 1:1439893‑M2/70‑8 (MQ=255) tGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcct < 1:1967956‑M2/69‑7 (MQ=255) gTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcctt < 1:2312555‑M2/69‑8 (MQ=255) aTACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgcctt > 1:2173824‑M2/1‑59 (MQ=255) tACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTaataaa < 1:1870337/71‑1 (MQ=255) aCCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTaataaa > 1:2747303/1‑70 (MQ=255) aCCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTaataaa > 1:14323/1‑70 (MQ=255) tcCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTtaata < 1:1428052/63‑1 (MQ=255) tcCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATAc > 1:2992952/1‑68 (MQ=255) gAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCa > 1:3085387/1‑71 (MQ=255) gAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCa > 1:2746403/1‑71 (MQ=255) gAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCa > 1:1834896/1‑71 (MQ=255) aaTTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCGGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAgcgc < 1:377999/69‑1 (MQ=255) aaTTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTaataaa > 1:2213232/1‑60 (MQ=255) ttGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTtaataa < 1:1078604/57‑1 (MQ=255) cAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttag < 1:1663630/71‑1 (MQ=255) cAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttag < 1:135846/71‑1 (MQ=255) aaGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttagt > 1:713751/1‑71 (MQ=255) aGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcaggagaggtatgacaat < 1:1501671‑M2/71‑32 (MQ=255) aGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcaggagaggtatgacaat < 1:1086351‑M2/71‑32 (MQ=255) ggCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttagt > 1:3374024/1‑69 (MQ=255) gCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttagttag > 1:1281683/1‑71 (MQ=255) gCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTttagt > 1:110110/1‑68 (MQ=255) gTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcagga > 1:2397589‑M2/1‑36 (MQ=255) gTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcagga > 1:2520607‑M2/1‑36 (MQ=255) gTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCt > 1:1892590/1‑71 (MQ=255) gATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTcc > 1:1372311/1‑70 (MQ=255) aTGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCg < 1:2623179/70‑1 (MQ=255) aTGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGa < 1:2428679/71‑1 (MQ=255) aTGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGa > 1:3091411/1‑71 (MQ=255) tGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcaggagaggtatgacaatgtcattaga > 1:2732937‑M2/1‑31 (MQ=255) tGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcaggagaggtatgacaatgtcattaga > 1:2858682‑M2/1‑31 (MQ=255) tGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGacgccttgcaattcaggagaggtatgacaatgtcattaga > 1:3053696‑M2/1‑31 (MQ=255) tGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGAt > 1:553973/1‑71 (MQ=255) gATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGa < 1:308361/47‑1 (MQ=255) gATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGAtt < 1:2368926/70‑1 (MQ=255) gATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGAtt < 1:3708030/70‑1 (MQ=255) gATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGAtt < 1:1026172/70‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGAtt < 1:3195531/69‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGt < 1:3124302/71‑1 (MQ=255) tAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATAc < 1:1311622/43‑1 (MQ=255) tAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTa > 1:1441600/1‑71 (MQ=255) aaaaaTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTaataaat > 1:3372532/1‑40 (MQ=255) aaaTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGa < 1:2696039/71‑1 (MQ=255) aaaTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGa < 1:135913/71‑1 (MQ=255) aaTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAgcg > 1:938650/1‑44 (MQ=255) aaTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATg > 1:3336185/1‑69 (MQ=255) aTCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAg < 1:3080383/71‑1 (MQ=255) cTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGcc < 1:723881/70‑1 (MQ=255) tCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGcc < 1:1723577/71‑1 (MQ=255) tCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGcc < 1:2655420/71‑1 (MQ=255) ttACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCt < 1:691845/71‑1 (MQ=255) tACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGt > 1:950837/1‑51 (MQ=255) tACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTa > 1:444544/1‑52 (MQ=255) aCCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTg < 1:1745420/70‑1 (MQ=255) aCCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTg < 1:2141263/70‑1 (MQ=255) gTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTGTCCAg < 1:316990/71‑1 (MQ=255) gTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTGTCCAg < 1:3006364/71‑1 (MQ=255) gACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGt > 1:3068984/1‑44 (MQ=255) gACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTGTc > 1:2932961/1‑66 (MQ=255) | ATGACATTGTCATACCTCTCCTGAATTGCAAGGCGTTGATGGATAAAAATCCTCGTCCCGATTACCGGTGACGCCTTAATAAATACGAGCGCACTTTAGTTAGCTCCGATTGTATGAAGCCGCGCCATCGCTGTCCAG > minE/2313378‑2313515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |