Missing coverage evidence...
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TACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAACTCT  >  minE/1832807‑1832868                                                              | tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:474107/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3111110/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:314718/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3229747/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3309841/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3314426/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3387796/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3423199/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:454535/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:461953/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:3046938/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:592294/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:600972/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:622430/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:625649/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:785427/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:798638/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:799395/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:888450/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:956149/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2299552/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1061487/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1646838/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1808778/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1994813/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2001174/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2063615/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1019209/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:23010/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2689470/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2713042/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2827455/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2833472/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2857104/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2874645/62‑1 (MQ=255) tACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2932056/62‑1 (MQ=255)  aCCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:2278432/61‑1 (MQ=255)          aTTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1278293/53‑1 (MQ=255)                         gAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAActct  <  1:1736276/38‑1 (MQ=255)                                                              | TACCGTCAAATTGCACCAGCCCGTGAAGTTGATGTGGCACGCTGCCTCTCAATTGAAACTCT  >  minE/1832807‑1832868

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑