Missing coverage evidence...
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CCGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTG  >  minE/1832871‑1832932 |                                                              ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTAc             >  1:1526432/1‑51 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACt   >  1:1160442/1‑61 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACt   >  1:2646164/1‑61 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2789778/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:958959/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2892230/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2916878/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2966499/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3023783/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3154690/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3158154/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3267780/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3268692/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3334540/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3373217/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3388903/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3403183/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:3487241/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:428467/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:590225/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:634599/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1000372/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2185437/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1213156/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1313936/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1552115/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1722129/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:1957451/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2046947/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2107806/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2780925/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2211478/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2255581/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2376900/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:241372/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2432615/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2574213/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:2650830/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTg  >  1:270832/1‑62 (MQ=255) ccGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTGGCTCCACTg  >  1:1866130/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGCTTATGCACACGAACTGGCAGAGTGGGTTCTGGGCCAGGAAAGTGTACTTGCTCCACTG  >  minE/1832871‑1832932

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑