Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1836881	1836888	8	13 [0]	[0] 54	rpoS	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor

TCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGACC  >  minE/1836820‑1836880                                                             | tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGccc  >  1:3278966/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:1044797/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:1199749/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:1623367/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:2299612/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:256714/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:2612496/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:2616679/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:3271919/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:3419619/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:354709/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGAcc  >  1:486617/1‑61 (MQ=255) tctcTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGACCAGCAACGCCAGAcc  >  1:3199194/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGACC  >  minE/1836820‑1836880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑