Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1836881	1836888	8	13 [0]	[0] 54	rpoS	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor

CATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGATCA  >  minE/1836889‑1836936 |                                                cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCTatca  <  1:1011919/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3470407/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2626630/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2734816/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2758867/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2779055/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2791009/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2974895/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2994632/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3001209/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3173549/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3286527/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3458880/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3466600/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2446016/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:3647799/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:523233/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:665508/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:689142/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:698363/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:712682/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:728436/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:737641/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:788394/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:852163/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:86851/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:934627/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1753593/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1037430/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:108194/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1132532/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1165542/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1298436/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:143355/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1459949/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1463297/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1494448/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1589948/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1653568/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1745291/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2316630/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1793581/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1815730/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:187136/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1903488/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:1928981/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2024479/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2035082/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2076846/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2249853/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2249964/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2250814/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGatca  <  1:2310017/48‑1 (MQ=255) cATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGat    <  1:3486496/46‑1 (MQ=255) |                                                CATAACGGCGGGCAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTCTCGATCA  >  minE/1836889‑1836936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑