Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2661904	2661939	36	39 [0]	[1] 79	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

TCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTT  >  minE/2661842‑2661903                                                              | tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAGAGGttt  >  1:3124702/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3245141/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2727464/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2733755/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:295592/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2987399/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3044255/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3202085/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3215779/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3238795/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2603207/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3339839/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3408811/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3500305/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:359884/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:3645718/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:437639/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:481393/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:610748/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:797373/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1826464/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1220937/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1255217/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1404687/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1500163/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1547994/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1587490/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1634170/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1640348/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1661738/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1188230/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:1954191/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2121417/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2125710/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2303977/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2336783/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2470419/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2560233/1‑62 (MQ=255) tCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGttt  >  1:2594671/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCCGGCGATAAGCTGAAAATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTT  >  minE/2661842‑2661903

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑