Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2744061	2744100	40	40 [0]	[0] 29	rplN	50S ribosomal subunit protein L14

AGAAGCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAGT  >  minE/2744007‑2744060                                                      | agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3192911/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1047636/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2476594/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2533392/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:253874/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:282705/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2948565/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2968667/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3028660/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3135370/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2379299/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3262445/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3352285/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3358225/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3390813/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3511813/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:3587686/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:674499/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:89556/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:972428/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1813365/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1146094/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1171571/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1396753/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:144564/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1651595/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1688879/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2309802/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1828983/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1860214/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1942745/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1987803/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2038231/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2129860/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2213244/54‑1 (MQ=255) agaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2290459/54‑1 (MQ=255)  gaagCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:430763/53‑1 (MQ=255)       aaTTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1650360/48‑1 (MQ=255)            cgcgTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:1633623/43‑1 (MQ=255)                 ggTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAgt  <  1:2043214/38‑1 (MQ=255)                                                      | AGAAGCAATTCCGCGTGGTAAGGTCAAAAAAGGTGATGTGCTGAAGGCGGTAGT  >  minE/2744007‑2744060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑