Missing coverage evidence...
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GTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCG  >  minE/2744101‑2744161 |                                                             gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2658257/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:934179/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:924298/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:913595/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:838398/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:744363/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:713944/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:633541/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:567118/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:542487/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:5417/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:458267/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:33443/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:3080193/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2981762/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:1007589/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2653956/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2630713/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2614588/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2564023/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:255171/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2527270/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2460971/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2348295/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:2275018/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:1737120/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:1237519/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:1156861/61‑1 (MQ=255) gTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCg  <  1:1099325/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTCATTCGCTTCGATGGTAATGCTTGTGTTCTTCTGAACAACAACAGCGAGCAGCCTATCG  >  minE/2744101‑2744161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑