Missing coverage evidence...
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AACACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGAAA  >  minE/2760145‑2760206                                                              | aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3502964/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2918875/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2925148/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:302693/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3059030/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3219047/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3284514/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3294147/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:336090/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3415762/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3462801/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2819551/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:3626294/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:459778/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:518025/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:531327/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:541396/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:630823/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:802638/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:837834/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:897019/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:9358/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2781440/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1078664/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1184618/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1283878/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1492949/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1515292/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1534936/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1553061/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1622772/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1670637/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1763060/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2073125/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2089440/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2167478/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2276758/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2341072/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2348256/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2393545/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2446591/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:2458247/62‑1 (MQ=255) aaCACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1073355/62‑1 (MQ=255)          cGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:559154/53‑1 (MQ=255)                           caGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGaaa  <  1:1871794/36‑1 (MQ=255)                                                              | AACACGGTCCGTTTCTTGGATGCTCACAGTATCCGGCGTGTGACTACGTCCGTCCTCTGAAA  >  minE/2760145‑2760206

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑