Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	260992	261088	97	72 [0]	[0] 60	yajI	predicted lipoprotein

GTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAG  >  minE/260944‑260991                                                | gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2630706/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3125672/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3114938/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2885703/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2828113/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2759736/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2711321/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2667152/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2639825/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3314640/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2563567/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2533245/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2457895/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2330387/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2237756/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2219474/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1019989/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2210122/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:468011/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:887330/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:869379/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:837382/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:834475/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:802938/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:70208/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:550057/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:483033/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2219219/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:453753/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:406218/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3613228/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3475260/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3416678/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3364813/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3321084/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1195099/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2207902/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1512624/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1512229/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:151161/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1362450/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1342345/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1284790/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1267392/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1592028/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1188689/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1182766/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1166397/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1158913/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1104591/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1036461/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1028834/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1731151/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2175669/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2174984/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2130355/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2101703/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2065791/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2040175/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:2030629/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1930013/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1866399/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1846290/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1812717/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1795156/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1765880/48‑1 (MQ=255) gTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCAGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1243468/48‑1 (MQ=255) gTTCCCCGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3235972/48‑1 (MQ=255)  ttCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGTCAAg  <  1:184856/47‑1 (MQ=255)  ttCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:3634042/47‑1 (MQ=255)           tttGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:1845981/38‑1 (MQ=255)             tGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAg  <  1:550607/36‑1 (MQ=255)                                                | GTTCCCTGAATTTGCCCATATTCAACAGTTCCGCTGAATGCGGGCAAG  >  minE/260944‑260991

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑