Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	260992	261088	97	72 [0]	[0] 60	yajI	predicted lipoprotein

TTTCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGA  >  minE/261089‑261143 |                                                       tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCTGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:503664/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:447966/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1035939/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3029987/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3060048/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3119221/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3168739/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3192090/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3325709/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:337493/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3465925/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3484273/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3538810/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3581519/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3593196/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3595004/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2970970/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:476752/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:50559/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:540087/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:584665/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:663056/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:751351/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:779445/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:802232/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:850205/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:893613/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:90498/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:931943/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:994357/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2006641/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1180660/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1304267/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1314120/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1339300/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1343830/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1447664/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1513513/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1516893/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1525830/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1611248/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1740956/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1785530/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1891124/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:1982188/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:293418/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2049892/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2061872/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2228074/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2271968/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2329413/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2355259/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2451454/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2456097/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:258779/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2767500/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2853560/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2881680/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:2932602/55‑1 (MQ=255) tttCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCGCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGa  <  1:3381803/55‑1 (MQ=255) |                                                       TTTCCAGTCTTGCCGGTGTTTTCGCTCCAGGCAGAAGGTAAACCCCACTGCTGGA  >  minE/261089‑261143

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑