Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2983555	2983590	36	51 [0]	[0] 40	creC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon

AACGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAT  >  minE/2983493‑2983554                                                              | accgcgGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:844403/60‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:379803/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2374629/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2439649/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2778175/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3081617/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3149933/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3155841/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3197293/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3291155/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3388055/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3512891/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3584184/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1055753/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:461148/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:513835/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:584292/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:586810/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:6377/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:678023/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:720981/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:796079/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:963105/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1696879/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1013931/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1129739/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1146994/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1216055/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1289831/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1341836/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1372057/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1526490/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1579835/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1664940/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2030448/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:214442/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2132509/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2091131/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:19176/62‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1983341/62‑1 (MQ=255)  aCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2879862/61‑1 (MQ=255)  aCGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGAGAGCGGAGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1893385/61‑1 (MQ=255)    gcggcgATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3535178/59‑1 (MQ=255)     cggcgATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1333075/58‑1 (MQ=255)      ggcgATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:3440303/57‑1 (MQ=255)          aTGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2735659/53‑1 (MQ=255)               tCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2263470/48‑1 (MQ=255)               tCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2865401/48‑1 (MQ=255)               tCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:2551429/48‑1 (MQ=255)                   ggcATTCAGCGTAGCGAGCGGCGAATTATATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1581362/42‑1 (MQ=38)                      aTTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAt  <  1:1941165/41‑1 (MQ=255)                                                              | AACGCGGCGATGGCTCCGGTCATTAAGCGTAGCGAGCGGCGAATTTTATGGGCCAGCGCCAT  >  minE/2983493‑2983554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑