Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2983555	2983590	36	51 [0]	[0] 40	creC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon

GGTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAC  >  minE/2983591‑2983651 |                                                             ggTTTGGTGGATCACCCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2483428/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCTCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:802840/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGa   >  1:908046/1‑60 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGa   >  1:825645/1‑60 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3573501/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2945659/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3131910/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3228239/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3275890/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3314743/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3418325/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3505018/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3533224/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:3534833/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2944644/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:428257/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:80583/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:808772/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:906844/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:932218/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:940494/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2043362/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1188133/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1246783/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1496926/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:159301/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1647764/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1674132/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1781735/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1863264/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1865664/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:1070684/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2079476/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2267207/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2452781/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2463056/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2484348/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2537337/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2783853/1‑61 (MQ=255) ggTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAc  >  1:2830620/1‑61 (MQ=255) |                                                             GGTTTGGTGGATCAACCGCTCTATTGCCCGGCTCACTCGCTATGCTGATTCCGTCACTGAC  >  minE/2983591‑2983651

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑