Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	397155	397253	99	41 [0]	[0] 33	lipA	lipoate synthase

CAGACTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGT  >  minE/397092‑397154                                                               | cagacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTT‑AAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:210516/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:3152607/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2600796/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2649670/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2668303/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2706761/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2730916/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2943340/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2967207/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2996718/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:3043662/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2548523/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:3554057/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:391711/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:45042/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:582769/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:638778/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:780702/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:828755/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:882205/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:992406/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1181023/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1216147/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1322024/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1473144/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1511733/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1651967/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1673975/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1099871/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1818678/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1998639/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2105364/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2109621/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2146690/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2470392/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:250918/62‑1 (MQ=255)  agacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACAAGt  <  1:1399636/62‑1 (MQ=255)   gacTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:2377672/61‑1 (MQ=255)       tGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:3349215/57‑1 (MQ=255)                tttCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1778869/48‑1 (MQ=255)                    cGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGt  <  1:1179839/44‑1 (MQ=255)                                                               | CAGACTTGGTCGGGATTTCCGGATGCGCTTCTTTAAAGCGTTCCAGCAGCTTCAGCGACCAGT  >  minE/397092‑397154

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑