Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1226479 1226483 5 83 [0] [0] 49 pphA serine/threonine‑specific protein phosphatase 1

TCAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTG  >  minE/1226416‑1226478
                                                              |
tCAACGTCCTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2220473/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATACACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:991677/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:338887/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2567482/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3388692/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3366155/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3320858/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3315409/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3307009/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3278455/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3232578/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:319173/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:307293/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3027846/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2946585/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2895882/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2884146/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2766190/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2702126/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2679300/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2535408/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:463773/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:978983/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:97182/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:912494/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:858624/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:831447/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:811176/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:739500/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:613044/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:533401/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3390269/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:456018/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:369535/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:365605/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3631365/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3609576/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3597583/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:355276/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3494302/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3475077/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1598314/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:102493/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:193245/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:189313/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1826816/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:175036/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1720441/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1716729/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1707376/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1673837/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1664439/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1943160/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1557680/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1413731/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1350111/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1329216/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1287029/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1265839/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1079925/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1048698/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:104367/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1958829/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:199349/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2512167/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2002453/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2157108/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2158219/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:221148/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2217172/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2396569/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2392158/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2260246/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2269297/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2331727/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2361116/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2367060/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACAAGCTTg  <  1:1982019/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGAAATAACATGCTTg  <  1:2671222/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTCGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:1877635/62‑1 (MQ=255)
 cAACGTCCTTTTGACATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2422822/62‑1 (MQ=255)
  aaCGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:2232489/61‑1 (MQ=255)
                           tcatcTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTg  <  1:3168978/36‑1 (MQ=255)
                                                              |
TCAACGTCCTTTTGCCATTCATAAACATCATCTGGATAATCGGCATGAGCAATAACATGCTTG  >  minE/1226416‑1226478

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: