Missing coverage evidence...
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CTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAATT  >  minE/1247242‑1247303                                                              | cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATACCCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2107377/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:272667/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:935909/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:839235/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:697380/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:578231/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:374042/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:3261787/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:3195438/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2965909/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2917158/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2902398/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1073518/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2203642/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2187639/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2145075/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:2008788/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1727370/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1647328/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1573455/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1546592/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1318570/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:1249982/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCACCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:663868/1‑62 (MQ=255) cTGAACAACAGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAAtt  >  1:927188/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGAACAACTGGGTATCTATCGCCATCATCATAACCATCGTCACGATTTACAGGGACGAATT  >  minE/1247242‑1247303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑