Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1527532	1527676	145	66 [0]	[0] 48	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

ACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTA  >  minE/1527492‑1527531                                        | aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCTCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2359843/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3222469/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3518421/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3497313/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3475370/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3417539/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3381401/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3377250/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:332954/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3581397/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3175692/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3060717/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3014640/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2929463/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2925938/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2916083/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1132846/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:28932/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:411919/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:429278/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:497250/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:5031/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:505584/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:536885/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:68958/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:712543/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:723679/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:770016/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:81320/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:820505/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:927347/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:953105/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:963779/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2167763/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1148731/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1170469/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1265984/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1269180/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1343754/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1347849/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1388915/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1432764/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1464928/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1477369/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:149038/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1619170/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1985974/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1998310/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:1999151/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2355736/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2741587/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2678042/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2623631/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2581396/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2537115/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2494491/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2459746/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2779404/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2308564/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2273557/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2268212/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2238953/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2217497/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:2190978/1‑40 (MQ=255) aCTGACCAGCCAACTGGACGATTAGCTAAATCAAAAACTa  >  1:676163/1‑40 (MQ=38) aCTGACCAGCCAACTCGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTa  >  1:3251149/1‑40 (MQ=255)                                        | ACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTA  >  minE/1527492‑1527531

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑