Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1527532	1527676	145	66 [0]	[0] 48	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

AGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTG  >  minE/1527677‑1527737 |                                                             aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGTGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3485828/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCTCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2586331/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:400533/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2797786/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2973802/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:307734/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:310372/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3176995/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3256954/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3296168/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3301403/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3329994/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:3446948/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2741916/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:553851/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:564027/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:609572/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:652207/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:708512/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:741283/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:82313/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:848192/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:944473/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:956634/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:986305/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2080635/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1036089/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1069237/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1186274/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1229757/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1318952/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1586978/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:178043/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1862484/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1937760/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1026571/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2114629/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:220534/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2208384/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2237592/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2368538/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2384452/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2425571/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2466288/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2479743/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:2505945/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAAAGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1095580/61‑1 (MQ=255) aGGACGCCGGAATCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTg  <  1:1801210/61‑1 (MQ=255) |                                                             AGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTG  >  minE/1527677‑1527737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑