Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2501812	2501819	8	30 [0]	[0] 63	uhpC	membrane protein regulates uhpT expression

TCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCATT  >  minE/2501820‑2501881 |                                                              tCGGCCTGTTAGCGCCCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:208849/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTAt                             >  1:219484/1‑35 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3182555/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3429441/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:339230/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3386728/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3281353/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3277017/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:327561/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2811877/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3095658/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3071793/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2964680/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:294633/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2932305/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2882095/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2800646/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:3649121/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:448229/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:463833/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:465068/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:480217/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:482204/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:536463/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:63869/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:710557/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:718723/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:734679/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:784394/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:797907/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:814296/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:85865/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2074738/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:116847/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1278015/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1307706/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1307784/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1424376/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1521547/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1741288/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1745338/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1765456/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1806692/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1841075/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1855921/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1904776/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2807981/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2319600/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2326054/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2419338/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:243241/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2539374/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2616121/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2666409/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2669907/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:26781/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2746126/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2751785/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2774860/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:2775111/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAtt  >  1:1097784/1‑62 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAt   >  1:1761490/1‑61 (MQ=255) tCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCAt   >  1:619565/1‑61 (MQ=255) |                                                              TCGGCCTGTTAGCGACCCTGTTTTACATTACCTATGGCGTGTCGAAGTTTGTCTCCGGCATT  >  minE/2501820‑2501881

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑