Missing coverage evidence...
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TGATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGG  >  minE/2545612‑2545673 |                                                              tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGgtg            >  1:2226558/1‑52 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTc     >  1:3118221/1‑59 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2465789/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:944596/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:702188/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3621404/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3496251/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3482308/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3310939/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3197837/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:308450/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:3066071/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2915907/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2821463/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2806153/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:248417/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1126897/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2449867/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:2384496/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:236068/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1986967/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1685389/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1546053/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1437583/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:127315/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:113733/1‑62 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCg   >  1:228140/1‑61 (MQ=255) tgATAGCCGGTAATCAAACGGATAACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1770873/1‑62 (MQ=255) tgATAGACGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCgg  >  1:1856336/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGATAGCCGGTAATCAAACGGATCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGG  >  minE/2545612‑2545673

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑