Missing coverage evidence...
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CATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAC  >  minE/1043864‑1043925 |                                                              cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGc                         >  1:1234140/1‑39 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGaa   >  1:15617/1‑61 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGaa   >  1:290658/1‑61 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGaa   >  1:3335599/1‑61 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3171321/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:944017/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:324325/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3308545/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:337359/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3488535/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3634715/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:443409/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:466102/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:666766/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:724612/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:798110/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:823357/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:90614/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3072841/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:1592079/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:1670834/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:1939196/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:1972407/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2131902/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2369174/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:268336/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2746566/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2762334/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2771795/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:2784440/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:286958/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3036769/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3129385/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGATGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:3609409/1‑62 (MQ=255) cATCGGTACGCAGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAc  >  1:1059542/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATCGGTACGCCGTCCTGCGCCAGCTGTTCGAAGTCCGCTTCACTCAGCGCACTCAAAGAAC  >  minE/1043864‑1043925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑