Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1317602	1317625	24	28 [1]	[0] 27	cld	regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

ATTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAG  >  minE/1317626‑1317686 |                                                             aTTACGCCCCCGCACAATCCCCGCGCCAACCATGc                            >  1:2322112/1‑35 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:2406240/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:613386/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:579963/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:575027/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:517544/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:3565934/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:3470928/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:3157898/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:3148333/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:2772955/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:2524055/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:2508899/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:2486870/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:241953/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1065530/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1887463/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1779236/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1777276/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1621872/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1593315/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1570978/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1302938/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1128538/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1119456/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAg  >  1:1106011/1‑61 (MQ=255) aTTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAAACATGCCACCCAGCAGCACCGCCa          >  1:1428470/1‑53 (MQ=255) |                                                             ATTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAG  >  minE/1317626‑1317686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑