Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1446625 1446632 8 41 [0] [0] 52 rcsC hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

CCTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATG  >  minE/1446633‑1446694
|                                                             
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3191489/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:223125/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:802071/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2627990/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2685087/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2782277/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:552042/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2941731/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:523208/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3175401/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2244382/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3293970/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:478387/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3336928/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3380498/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3425195/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:345303/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3501137/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:3616188/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1742478/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:9519/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1221752/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1410152/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:151796/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1724028/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1737590/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:925904/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1740937/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1755624/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:198547/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2032002/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2037385/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:2167269/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:1120177/60‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:521361/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:1067114/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:974146/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:945653/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:740569/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:991383/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:3314898/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:3069761/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:2961732/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:2794747/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:2720162/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:2605715/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:2194552/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:1293416/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:1279244/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:1275864/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATg  <  1:1221234/62‑1 (MQ=255)
ccTTAATTTTACTTTCTGGGCCGGTAAGCGAAATCAGGGGATGACCATTTTCATCAAGaa    <  1:720513/60‑1 (MQ=255)
|                                                             
CCTTAATTTTACTTTCTGGTCCGGTAAGCGAAATCAGGGTATGACCATTTTCATCAAGAATG  >  minE/1446633‑1446694

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: