Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557720	1557759	40	55 [0]	[0] 53	emrY	predicted multidrug efflux system

CGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAA  >  minE/1557760‑1557821 |                                                              cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCa               >  1:3274972/1‑49 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGa       >  1:3485193/1‑57 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGa       >  1:2169173/1‑57 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3473927/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2844564/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2860189/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2875344/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2934600/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3017982/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3090045/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3103670/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3169075/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3222424/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3305985/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3405448/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2737062/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3474136/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:3481138/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:470236/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:549653/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:735921/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:741646/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:771150/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:803230/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:951119/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:961216/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:964465/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1848651/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1070980/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1168088/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:124084/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1327354/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1341015/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1429731/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1452264/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1582647/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1586683/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1626469/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1637570/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2812601/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1933729/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2226074/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2300896/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2310348/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2428324/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2505911/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2566905/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2609975/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2659143/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2660694/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:2692184/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAaataa  >  1:1051818/1‑62 (MQ=255) cGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGATGTCCATTATGCGAaataa  >  1:14617/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGTTAATGGTGCCGGAGTTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAA  >  minE/1557760‑1557821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑