Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2543371	2543376	6	18 [0]	[0] 37	rfaL	O‑antigen ligase

GACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGT  >  minE/2543310‑2543370                                                             | gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:44092/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:931043/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:919363/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:78851/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:737950/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:697460/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:687297/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:648476/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:525394/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:1055622/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:439841/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:43254/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:364994/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:340579/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:29589/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:286060/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:1184963/1‑61 (MQ=255) gACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGt  >  1:1143157/1‑61 (MQ=255)                                                             | GACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGT  >  minE/2543310‑2543370

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑