Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2543371	2543376	6	18 [0]	[0] 37	rfaL	O‑antigen ligase

CCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAA  >  minE/2543377‑2543437 |                                                             cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCaaa                           >  1:10390/1‑36 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGtt                    >  1:521320/1‑43 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTatat            >  1:1061617/1‑51 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCtatata    >  1:352945/1‑59 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCtatat     >  1:789382/1‑58 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCtata      >  1:95074/1‑57 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCta        >  1:851801/1‑55 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCta        >  1:1183439/1‑55 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCta        >  1:766088/1‑55 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaaa  >  1:1180558/1‑61 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:498646/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:4381/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:510177/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:561450/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:569609/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:673743/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:676513/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:771219/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:790354/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:921595/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:966349/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:473856/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:455485/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:446838/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:40468/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:398938/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:276466/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:261932/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:178209/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:129765/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1168403/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1152587/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1151273/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1120210/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1096831/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1062162/1‑60 (MQ=255) cccACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATaa   >  1:1058437/1‑60 (MQ=255) |                                                             CCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAA  >  minE/2543377‑2543437

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑