Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	18039	18101	63	15 [0]	[0] 37	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

TTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGT  >  minE/17980‑18038                                                           | ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAATTTGGt  <  1:86211/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:1009406/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:1050691/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:132119/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:17223/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:204480/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:204838/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:211751/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:441390/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:533744/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:681238/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:744564/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGCAGAAATTGGt  <  1:1139420/59‑1 (MQ=255) ttGCCCCAACGCTTTATGCATATAACTTTTTTGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:556257/59‑1 (MQ=255)  tGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt  <  1:966193/58‑1 (MQ=255)                                                           | TTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGT  >  minE/17980‑18038

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑