Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	18039	18101	63	15 [0]	[0] 37	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

GCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATC  >  minE/18102‑18163 |                                                              gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTaa    >  1:41498/1‑60 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAAt   >  1:561846/1‑61 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:683570/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:508417/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:638084/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:638998/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:663501/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:667248/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:672560/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:411646/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:692940/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:694153/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:718477/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:765549/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:794476/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:878163/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:889862/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:980474/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:189073/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1013804/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:103410/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1115784/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1139703/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1174686/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1175279/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:127594/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:174118/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1011403/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:204519/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:228621/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:308213/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:33525/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:336053/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:366729/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:383843/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGCTGCGTTAATc  >  1:653912/1‑62 (MQ=255) gcggTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTATGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc  >  1:1097709/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATC  >  minE/18102‑18163

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑