Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1287176	1287178	3	28 [0]	[0] 40	shiA	shikimate transporter

TCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGATTT  >  minE/1287114‑1287175                                                              | tctcGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:605992/4‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCTTTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:872437/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:504972/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:931626/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:927057/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:904637/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:882554/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:867537/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:778897/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:749852/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:71556/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:686756/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:589873/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:517456/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:1002030/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:503453/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:40863/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:398308/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:381701/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:246050/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:239584/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:1647/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:138940/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:1126361/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:1090297/1‑62 (MQ=255) tCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:107225/1‑62 (MQ=255) tCCAGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:390376/1‑62 (MQ=255) tCCAGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGAttt  >  1:388921/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCGCCGCATTTGCTACCTTTGGCGTCGGATTT  >  minE/1287114‑1287175

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑