Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1559200	1559333	134	54 [0]	[0] 36	emrK/evgA	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with EvgS

GCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACA  >  minE/1559140‑1559199                                                            | gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGTTACa  <  1:945888/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGTTACa  <  1:609697/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:710597/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:444691/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1020004/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:479381/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:493328/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:508560/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:519609/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:568141/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:677135/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:688911/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:702088/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:706755/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:445070/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:731427/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:79908/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:830947/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:892320/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:920190/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:955269/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:960690/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:969565/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:977392/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:99985/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:404833/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1046958/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1104268/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1170533/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1187003/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:143396/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:171395/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:176361/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:192663/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:207935/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:219782/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:231132/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:237364/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:399428/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:339904/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:27556/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:249177/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTAAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:132885/60‑1 (MQ=255)  ccTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1042064/59‑1 (MQ=255)  ccTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1046068/59‑1 (MQ=255)  ccTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:419327/59‑1 (MQ=255)  ccTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:803608/59‑1 (MQ=255)  ccTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:243604/59‑1 (MQ=255)       aGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:1198775/54‑1 (MQ=255)            tAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:760886/49‑1 (MQ=255)             aGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:212272/48‑1 (MQ=255)                  gaagaCTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:935989/43‑1 (MQ=255)                  gaagaCTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:233996/43‑1 (MQ=255)                     gaCTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACa  <  1:803691/40‑1 (MQ=255)                                                            | GCCTGTAGGATTAGTAAGAAGACTTATAGTGCCAACTTGAAACTATAAATCATCGGTACA  >  minE/1559140‑1559199

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑