Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1559200	1559333	134	54 [0]	[0] 36	emrK/evgA	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with EvgS

ACAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGAT  >  minE/1559334‑1559395 |                                                              acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGTGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:561190/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:674187/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:49853/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:574103/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:575004/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:60194/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:604038/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:627823/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:635169/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:488811/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:680429/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:813804/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:83910/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:87187/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:877910/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:932549/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:939077/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:943488/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:176758/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1109131/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1109208/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1110693/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1142694/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1163985/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1164984/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1196524/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:123703/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:1050457/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:181423/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:246096/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:247298/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:279726/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:288545/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:36855/62‑1 (MQ=255) acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:420697/62‑1 (MQ=255) acAGGGACAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATtgat  <  1:298298/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGAT  >  minE/1559334‑1559395

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑