Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562641	1562717	77	74 [0]	[0] 35	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

CGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAAC  >  minE/1562579‑1562640                                                              | cgcgGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1050395/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCACAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:990966/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACTATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:8919/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaagaacaac  >  1:139112/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaactacaac  >  1:1172488/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:671078/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:449775/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:646814/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:637805/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:636849/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:628012/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:571911/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:56898/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:560596/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:540537/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:531948/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:528020/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:510486/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:48081/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:46591/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:457520/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:407668/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:67269/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:721067/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:721928/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:754854/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:796221/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:814912/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:815344/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:817246/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:833592/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:86158/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:890912/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:89160/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:901586/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:903384/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:941119/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:954202/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1158578/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:164787/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:154121/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:149762/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1202450/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1197229/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1195391/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1184600/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1163631/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:404558/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1142381/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1113641/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1092264/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1081462/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1065732/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1038992/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1015936/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:283831/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:1007659/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:403084/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:400919/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:400853/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:395243/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:301321/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:293054/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:166293/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:276601/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:256216/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:253235/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:201576/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:20058/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:167058/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaaaaacaac  >  1:1109804/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATAATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:334532/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGAGTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:679854/1‑62 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCGGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaac  >  1:672100/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAAC  >  minE/1562579‑1562640

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑